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Enregistrement W2588078539 · doi:10.1093/neuonc/now212.171

CSIG-10. SHH-MEDULLOBLASTOMA PREFERENTIALLY ARISES FROM GRANULE CELL PRECURSORS IN THE LATERAL CEREBELLUM

2016· article· en· W2588078539 sur OpenAlexaff
I‐Li Tan, Alexandre Wojcinski, Harikrishna Rallapalli, Eugenia Volkova, Marc Remke, Andrey Korshunov, Daniel H. Turnbull, Michael R. Taylor, Alexandra L. Joyner

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedulloblastomaCerebellumPTCH1BiologySonic hedgehogGranule cellWnt signaling pathwayCancer researchPopulationCerebellar vermisNeurosciencePathologyCell biologyMedicineCentral nervous systemSignal transductionDentate gyrus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cerebellar tumor Medulloblastoma (MB) is the most common malignant pediatric brain tumor. Aggressive treatments including surgery, radiotherapy and chemotherapy for these young patients can greatly affect their motor control and cognitive and social behaviors controlled by the cerebellum. Mechanistic studies of MB progression are urgently needed in order to develop less toxic targeted therapies. MB is divided into four subgroups: WNT, SHH, Group 3 and Group 4. SHH-MB comprises 30% of all MBs and the main cell type of origin is granule cell progenitors (GCPs), which comprise a transient amplifying population in the developing cerebellum regulated by SHH signaling. We utilized inducible recombinases to overexpress a constitutively active form of SMO (SmoM2) or delete Ptch1 in few GCPs at Postnatal (P) day 2. Interestingly, we found that 200 SmoM2 mutant cells are sufficient to generate tumors and all tumors develop only in the lateral cerebellum (hemispheres). This finding correlates with MRI studies showing that SHH-MB subgroup patients have tumors preferentially in the hemispheres, whereas the other subgroups are found almost exclusively in the midline (vermis). We hypothesized that SHH-MB arises mainly in the hemispheres because GCPs are intrinsically different in this location. By using a mosaic analysis to test whether susceptibility to hyperactivation of the SHH pathway is regionally regulated, we discovered that Ptch1/SmoM2 mutant GCPs in the hemispheres indeed differentiate less compared to the vermis. Microarray analysis of P8 GCPs and P21 pre-neoplastic lesions revealed subsets of genes that are differentially expressed between the vermis and hemispheres, and between the two stages. We are validating candidate genes that could contribute to tumorigenesis. Our studies should provide new insights into the cellular and genetic mechanisms underlying SHH-MB progression, and to the identification of novel drug targets to aid in development of new therapies for this childhood tumor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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