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Enregistrement W2588083012 · doi:10.1093/neuonc/now212.333

GENT-27. COMPREHENSIVE MOLECULAR CHARACTERIZATION OF N-ETHYL-N-NITROSOUREA INDUCED RAT GLIOMAS

2016· article· en· W2588083012 sur OpenAlexaff
Wajid Sayeed, Michael Blough, Gregory Cairncross

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueHealth, Environment, Cognitive Aging
Établissements canadiensInstitute of Cancer ResearchUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésATRXGliomaOffspringIn uteroImmunohistochemistryEpigeneticsBiologyDNA methylationAstrocytomaPathologyMedicinePregnancyCancer researchFetusGeneMutationGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gliomas affecting children and young adults are genetically distinct from those in older adults. Next-generation sequencing has revealed unique mutations, methylation patterns, and expression profiles, which now define age- and location-specific glioma subtypes. While most gliomas that arise in children and young adults have no known cause, epidemiologic studies have shown an association between maternal consumption during pregnancy of foods high in N-nitroso-compounds (NOCs) and the development of brain tumors in their children. Likewise, in utero exposure to NOCs is known to cause astrocytomas, oligodendrogliomas, and glioblastomas in young rats. Here we test the hypothesis that ENU-induced gliomas bear genomic and epigenetic alterations that resemble those found in the gliomas of children and young adults. The possibility that some gliomas are caused by exposures that are preventable and occur in utero is the clinical rationale for this study. Pregnant Sprague-Dawley rats were exposed to intravenous ENU and their offspring monitored by MRI for the development of gliomas. Animals were euthanized when they developed large gliomas (i.e., >5mm) or became symptomatic. Tumour tissues were harvested, cultured and analyzed histopathologically and immunohistochemically (IHC); RNA and DNA were also extracted from these tissues for sequencing and methylation studies. In our first cohort, all control pups were glioma-free and 11/11 pups exposed in utero developed MRI-detectable astrocytic gliomas. All tumours expressed ATRX, one expressed Olig2 and none were IDH R132H positive by IHC. Next-generation sequencing of tumor tissues is planned and three rat glioma cell lines have been established.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,079
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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