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Enregistrement W2588087836 · doi:10.1093/jxb/erx003

Cellular localization of the Arabidopsis class 2 phytoglobin influences somatic embryogenesis

2017· article· en· W2588087836 sur OpenAlexafffund
Cara Godee, Mohamed M. Mira, Owen Wally, Robert D. Hill, Claudio Stasolla

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensGovernment of CanadaAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Manitoba
Mots-clésBiologyArabidopsisCell biologyCytoplasmSomatic embryogenesisAuxinSubcellular localizationSomatic cellGlucocorticoid receptorMutantMolecular biologyBiochemistryEmbryoReceptorEmbryogenesisGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutation of phytoglobin 2 (Pgb2) increases the number of somatic embryos in Arabidopsis. To assess the effects of the cellular localization of Pgb2 on embryo formation, an inducible system expressing a fusion protein consisting of Pgb2 linked to the steroid-binding domain of the rat glucocorticoid receptor (GR) was introduced in a pgb2 mutant line lacking the ability to express Pgb2. In this transgenic system, Pgb2 remains in the cytoplasm but migrates into the nucleus upon exposure to dexamethasone (DEX). Pgb2 retention in the cytoplasm, in the absence of DEX, increased the number of somatic embryos and reduced the expression of MYC2 - an inhibitor of the synthesis of auxin, which is the inductive signal for embryogenesis. Removal of DEX also induced the expression of several genes involved in the biosynthesis of tryptophan and the auxin, indole-3-acetic acid (IAA). These genes included: tryptophan synthase-α subunit (TSA1) and tryptophan synthase-β subunit (TSB1), which are involved in the synthesis of tryptophan, cytochrome P450 CYP79B2 (CYP79B2) and amidase 1 (AMI1), which participate in the formation of IAA via indole-3-acetaldoxime, and several members of the YUCCA family, including YUC1 and 4, which are also required for IAA synthesis. Retention of Pgb2 in the cytoplasm by removal of DEX increased the staining pattern of IAA along the cotyledons of the explants generating embryogenic tissue. Staining for IAA decreased when Pgb2 translocated into the nucleus in response to the application of DEX. Collectively, these results suggest that the presence of Pgb2 in the cytoplasm, but not in the nucleus, phenocopies the effects of Pgb2 mutation in inducing somatic embryogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,247

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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