Genomic Instability Is Frequent in Oral and Rare in Nasal Mucosal Cells of Allogeneic HCT Recipients.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Genomic Instability (GI), appraised by microsatellite length alteration, is a precancerous or cancerous condition. We hypothesized that genomic instability is frequent in oral but not nasal mucosal cells of HCT recipients as oral but not nasal carcinoma is frequent in long-term HCT survivors.We examined epithelial cells from buccal and nasal mucosa of 35 subjects for the presence of GI at 15 microsatellite loci spanning 14 human autosomes. The study population included long-term allo-HCT survivors (4–22 yrs, n=18) and short-term allo-HCT survivors (2–3 months, n=5), and long-term auto-HCT survivors (4–12 yrs, n=5). Controls also included 5 patients treated with intensive chemotherapy and 2 healthy volunteers. DNA extracted from peripheral blood leukocytes and cells of nasal and buccal mucosa was PCR amplified for a panel of 15 Short tandem repeat (STR) markers (ABI-Identifiler TM). The amplicons were subjected to capillary electrophoresis and fragment size analysis was performed to identify novel allele peaks (one that was absent in donor and recipient blood pre-transplant but present in recipient mucosa post-transplant) indicative of microsatellite instability (MSI). MSI was observed in buccal mucosal cells of 56% long-term survivors of allo-HCT; the number of STR loci showing novel allele peaks ranged from 1–6 (median=3). None of the short-term survivors of allo-HCT, long-term survivors of auto-HCT, or control individuals showed MSI in the buccal mucosal cells. Only one allogeneic HCT survivor showed MSI (at one STR locus) in nasal mucosal cells. No genomic alterations were observed in blood leukocytes of any of the above patients or controls. In conclusion, genomic instability is frequently observed in long-term allo-HCT suvivors in oral mucosal cells but rarely in nasal mucosal cells. The facts that oral but not nasal mucosa is frequently involved in chronic GVHD and that MSI was not detected in recipients of auto-HCT suggest that graft-vs-host reaction induces genomic instability.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».