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Enregistrement W2588267243 · doi:10.1038/ncomms14432

CX-5461 is a DNA G-quadruplex stabilizer with selective lethality in BRCA1/2 deficient tumours

2017· article· en· W2588267243 sur OpenAlexafffundabout
Hong Xu, Marco Di Antonio, Steven McKinney, Veena Mathew, Brandon Ho, Nigel J. O’Neil, Nancy Dos Santos, Jennifer Silvester, Vivien Wei, Jessica Garcia, Farhia Kabeer, Daniel Lai, Priscilla Soriano, Judit P. Banáth, Derek S. Chiu, Damian Yap, Daniel D. Le, Frank B. Ye, Anni Zhang, Kelsie L. Thu, John Soong, Shu‐Chuan Lin, Angela Hsin Chin Tsai, Tomo Osako, Teresa Ruiz de Algara, Darren N. Saunders, Jason W.H. Wong, Jian Xian, Marcel B. Bally, James D. Brenton, Grant W. Brown, Sohrab P. Shah, David W. Cescon, Tak W. Mak, Carlos Caldas, Peter C. Stirling, Phil Hieter, Shankar Balasubramanian, Samuel Aparício

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer ResearchCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of TorontoTerry Fox Research InstitutePrincess Margaret Cancer CentreBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox Research InstituteCancer Research UKBC Cancer FoundationStand Up To CancerHealthwayGovernment of Ontario
Mots-clésDNA damageDNA repairDNACancer researchBiologyG-quadruplexSynthetic lethalityChemistryGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

G-quadruplex DNAs form four-stranded helical structures and are proposed to play key roles in different cellular processes. Targeting G-quadruplex DNAs for cancer treatment is a very promising prospect. Here, we show that CX-5461 is a G-quadruplex stabilizer, with specific toxicity against BRCA deficiencies in cancer cells and polyclonal patient-derived xenograft models, including tumours resistant to PARP inhibition. Exposure to CX-5461, and its related drug CX-3543, blocks replication forks and induces ssDNA gaps or breaks. The BRCA and NHEJ pathways are required for the repair of CX-5461 and CX-3543-induced DNA damage and failure to do so leads to lethality. These data strengthen the concept of G4 targeting as a therapeutic approach, specifically for targeting HR and NHEJ deficient cancers and other tumours deficient for DNA damage repair. CX-5461 is now in advanced phase I clinical trial for patients with BRCA1/2 deficient tumours (Canadian trial, NCT02719977, opened May 2016).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations588
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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