Micro-epidemiological structuring of Plasmodium falciparum parasite populations in regions with varying transmission intensities in Africa
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
<ns4:p> <ns4:bold>Background:</ns4:bold> The first models of malaria transmission assumed a completely mixed and homogeneous population of parasites. Recent models include spatial heterogeneity and variably mixed populations. However, there are few empiric estimates of parasite mixing with which to parametize such models. </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Methods</ns4:bold> : Here we genotype 276 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in 5199 <ns4:italic>P. falciparum</ns4:italic> isolates from two Kenyan sites (Kilifi county and Rachuonyo South district) and one Gambian site (Kombo coastal districts) to determine the spatio-temporal extent of parasite mixing, and use Principal Component Analysis (PCA) and linear regression to examine the relationship between genetic relatedness and distance in space and time for parasite pairs. </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Results:</ns4:bold> Using 107, 177 and 82 SNPs that were successfully genotyped in 133, 1602, and 1034 parasite isolates from The Gambia, Kilifi and Rachuonyo South district, respectively, we show that there are no discrete geographically restricted parasite sub-populations, but instead we see a diffuse spatio-temporal structure to parasite genotypes. Genetic relatedness of sample pairs is predicted by relatedness in space and time. </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Conclusions</ns4:bold> : Our findings suggest that targeted malaria control will benefit the surrounding community, but unfortunately also that emerging drug resistance will spread rapidly through the population. </ns4:p>
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle