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Enregistrement W2588407548 · doi:10.1161/atvb.32.suppl_1.a134

Abstract 134: A Double Heterozygote for LCAT and ABCA1 Mutations Accounts for Severe Hypoalphalipoproteinemia

2012· article· en· W2588407548 sur OpenAlexaff
Adam D. McIntyre, Robert A. Hegele

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProbandTangier diseaseCompound heterozygosityGeneticsHeterozygote advantageAsymptomaticLocus (genetics)BrotherEndocrinologyFamilial hypercholesterolemiaMedicineInternal medicineMutationABCA1GeneCholesterolAlleleBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report a family with extremely depressed high density lipoprotein (HDL) cholesterol (C) levels. The proband, a 27 year-old male of Asian Indian origin, was identified on routine lipid screening to have an HDL-C of 9mg/dL. His 24 year-old brother had an HDL-C of 6mg/dL and was therefore referred to a local lipid clinic in 1997. Both brothers were asymptomatic. The nuclear family was comprised of another brother and a mother living in India; their father had died previously from an undetermined cause. The parents were second cousins. Blood was obtained from members of the extended family and showed that the mother’s HDL-C was reduced at 29mg/dL, while the 3rd bother had a normal HDL-C at 54mg/dL. Based on the above scenario, a homozygous mutation most likely involving ABCA1 was presumed to be responsible for this lipoprotein profile. However, microsatellite marker analyses of the ABCA1 locus showed no homozygosity pattern in the two affected brothers. Further analyses of the APOA1-C3-A4 locus similarly failed to show homozygosity in the affected brothers. Plasma activities of both salt-stimulated paraoxanase and LCAT were at the low end of normal. Direct sequence analyses of the LCAT gene showed all three brothers were heterozygous for the Arg423His mutation, while the mother’s LCAT gene sequence was normal. No further work was pursued until 2011, when this family’s DNA was re-examined by direct sequencing. On this occasion, a heterozygous mutation in ABCA1 was found, namely Arg1270X in the 2 affected brothers and their mother. To our knowledge, this is the first report of ’double heterozygosity’ for LCAT and ABCA1 mutations producing severe hypoalphalipoproteinemia. Further, simple heterozygosity for the ABCA1 Arg1270X mutation had a co-dominant influence, moderately reducing HDL-C levels. In contrast, simple heterozygosity for the LCAT Arg423His mutation had no effect on HDL-C, but in the presence of ABCA1 Arg1270X it contributed to markedly reduced HDL-C. This case report highlights a potential pitfall in human genetic studies, namely assuming a particular inheritance pattern based upon family structure. It also highlights the value of perseverance by searching for causative mutations in more than one gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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