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Enregistrement W2588442711 · doi:10.1038/srep42713

Her2 alterations in muscle-invasive bladder cancer: Patient selection beyond protein expression for targeted therapy

2017· article· en· W2588442711 sur OpenAlexaff
Bernhard Kiss, Alexander W. Wyatt, James J. Douglas, Veronika Skuginna, Fan Mo, Shawn Anderson, Diana Rotzer, Achim Fleischmann, Vera Genitsch, Tetsutaro Hayashi, Maja Neuenschwander, Christine Buerki, Elai Davicioni, Colin C. Collins, George N. Thalmann, Peter C. Black, Roland Seiler

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBladder and Urothelial Cancer Treatments
Établissements canadiensGenome British ColumbiaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBladder cancerTargeted therapyContext (archaeology)Breast cancerCancerMedicineBioinformaticsOncologyCancer researchInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although the introduction of novel targeted agents has improved patient outcomes in several human cancers, no such advance has been achieved in muscle-invasive bladder cancer (MIBC). However, recent sequencing efforts have begun to dissect the complex genomic landscape of MIBC, revealing distinct molecular subtypes and offering hope for implementation of targeted therapies. Her2 (ERBB2) is one of the most established therapeutic targets in breast and gastric cancer but agents targeting Her2 have not yet demonstrated anti-tumor activity in MIBC. Through an integrated analysis of 127 patients from three centers, we identified alterations of Her2 at the DNA, RNA and protein level, and demonstrate that Her2 relevance as a tumor driver likely may vary even within ERBB2 amplified cases. Importantly, tumors with a luminal molecular subtype have a significantly higher rate of Her2 alterations than those of the basal subtype, suggesting that Her2 activity is also associated with subtype status. Although some of our findings present rare events in bladder cancer, our study suggests that comprehensively assessing Her2 status in the context of tumor molecular subtype may help select MIBC patients most likely to respond to Her2 targeted therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,641

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations115
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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