MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2588447148 · doi:10.1182/blood.v108.11.1038.1038

Galectin-3 Binding Protein Contaminates the Purification of Recombinant Factor IX.

2006· article· en· W2588447148 sur OpenAlexaff
Mark Blostein, Jessica Cuerquis, Jacques Galipeau

Notice bibliographique

RevueBlood · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFactor IXRecombinant DNAAffinity chromatographyHEK 293 cellsTransfectionMolecular biologyBiologyChemistryBiochemistryGeneEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The hemophilas are the most common severe hereditary bleeding disorders. The standard treatment of these disorders is to infuse plasma concentrates of the missing coagulation factor. However, the high cost of replacement therapy and the serious morbidity from the transmission of infectious agents have mandated a need for alternative therapeutic strategies. One of these strategies is gene therapy and we embarked on a novel gene therapeutic strategy involving the use of factor IX-transduced bone marrow stroma to treat hemopihlia B, a deficiency of the gamma-carboxylated protein, factor IX. The rate limiting step for the production of factor IX is gamma-carboxylation, a post translational modification carried out only in mammalian cells. In order to test the carboxylation efficiency of our gene therapeutic platform, we first transfected Human Embryonic Kidney (HEK) 293 cells with a retroviral construct containing factor IX. Factor IX was purified by immunoaffinity chromatography and then subject to hydroxyapatite chromatography to isolate biologically active properly carboxylated factor IX from inactive uncarboxylated factor IX. Unexpectedly, during hydroxyapatite chromatography, we discovered that purified factor IX was contaminated by a heretofore unknown protein. Further analysis by mass spectrometry sequencing revealed this protein to be galectin-3 binding protein (G3BP).G3BP contaminates media of HEK293 cells regardless of whether factor IX is transfected into these cells. Furthermore, the contamination of purified media is not specific for factor IX as G3BP is isolated regardless of the antibody used for purification. In summary, the above results provide important information regarding the production of recombinant factor IX and uncover a potentially new contaminant in recombinant products produced in mammalian cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBloodMême sujetCancer-related gene regulationTravaux en français237 207