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Enregistrement W2588502186 · doi:10.1128/aem.03319-16

Plant Community and Nitrogen Deposition as Drivers of Alpha and Beta Diversities of Prokaryotes in Reconstructed Oil Sand Soils and Natural Boreal Forest Soils

2017· article· en· W2588502186 sur OpenAlexafffundabout
Jacynthe Masse, Cindy E. Prescott, Sébastien Renaut, Yves Terrat, S. J. Grayston

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésSoil waterTaigaEnvironmental scienceNitrogenBETA (programming language)Deposition (geology)Alpha (finance)Environmental chemistryEcologySoil scienceBiologyChemistryMathematicsPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The Athabasca oil sand deposit is one of the largest single oil deposits in the world. Following surface mining, companies are required to restore soil-like profiles that can support the previous land capabilities. The objective of this study was to assess whether the soil prokaryotic alpha diversity (α-diversity) and β-diversity in oil sand soils reconstructed 20 to 30 years previously and planted to one of three vegetation types (coniferous or deciduous trees and grassland) were similar to those found in natural boreal forest soils subject to wildfire disturbance. Prokaryotic α-diversity and β-diversity were assessed using massively parallel sequencing of 16S rRNA genes. The β-diversity, but not the α-diversity, differed between reconstructed and natural soils. Bacteria associated with an oligotrophic lifestyle were more abundant in natural forest soils, whereas bacteria associated with a copiotrophic lifestyle were more abundant in reconstructed soils. Ammonia-oxidizing archaea were most abundant in reconstructed soils planted with grasses. Plant species were the main factor influencing α-diversity in natural and in reconstructed soils. Nitrogen deposition, pH, and plant species were the main factors influencing the β-diversity of the prokaryotic communities in natural and reconstructed soils. The results highlight the importance of nitrogen deposition and aboveground-belowground relationships in shaping soil microbial communities in natural and reconstructed soils. IMPORTANCE Covering over 800 km 2 , land disturbed by the exploitation of the oil sands in Canada has to be restored. Here, we take advantage of the proximity between these reconstructed ecosystems and the boreal forest surrounding the oil sand mining area to study soil microbial community structure and processes in both natural and nonnatural environments. By identifying key characteristics shaping the structure of soil microbial communities, this study improved our understanding of how vegetation, soil characteristics and microbial communities interact and drive soil functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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