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Enregistrement W2588580595 · doi:10.1139/cjm-2016-0448

Aerobic anoxygenic phototrophs in gold mine tailings in Nopiming Provincial Park, Manitoba, Canada

2017· article· en· W2588580595 sur OpenAlexaffvenueabout
Elizabeth Hughes, Breanne M. Head, Chris Maltman, Michele D. Piercey‐Normore, Vladimir Yurkov

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueGeochemistry and Elemental Analysis
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhototrophAnoxygenic photosynthesisAlphaproteobacteria16S ribosomal RNABiologyTellurateTailingsFood scienceMicrobiologyChemistryBotanyEnvironmental chemistryBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A sampling trip to Central Gold Mine, Nopiming Provincial Park, Canada, was taken in September 2011. Abundance, distribution, and physiology of aerobic anoxygenic phototrophs (AAP) from 4 locations were studied. Enumeration revealed 14.6% of culturable microbes were AAP. Five strains (NM4.16, NM4.18, C4, C9, C11) were chosen for analysis. All grow best on complex media without vitamin requirements and with an optimal pH 7.0-8.0, with strain C4 preferring pH 6.0. Strain NM4.18 tolerates the highest pH 11.0. Optimal temperature for all is 28 °C (range of 2-37 °C except NM4.16, which survives 45 °C). Strains C9, C11, and NM4.18 grew in 1.0%, 2.0%, and 5.0% NaCl, respectively, while NM4.16 and C4 grew only without NaCl. Isolates were all highly resistant to toxic metal(oid) oxides: tellurite (1500 μg/mL, all), tellurate (1500 μg/mL, C11), selenite (5000 μg/mL, C9, C11, and NM4.18), selenate (1000 μg/mL, C9 and C11), and orthometavanadate and metavanadate (5000 μg/mL, C11 and NM4.18). They could reduce tellurite to the less toxic elemental tellurium. Full 16S rRNA gene sequencing revealed all strains are Alphaproteobacteria, with C4 and NM4.16 closely related to Porphyrobacter colymbi (99.4% and 99.7% sequence similarity, respectively), C9 to Brevundimonas variabilis (99.1%), C11 to Brevundimonas bacteroides (98.6%), and NM4.18 to Erythromonas ursincola (98.5%).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,934

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,172
Écart entre enseignants0,163 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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