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Enregistrement W2588612745 · doi:10.3168/jds.2016-12315

Short communication: Diagnostic performance of on-farm bacteriological culture systems for identification of uterine Escherichia coli in postpartum dairy cows

2017· article· en· W2588612745 sur OpenAlexaff
J. Dubuc

Notice bibliographique

RevueJournal of Dairy Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueReproductive Physiology in Livestock
Établissements canadiensUniversité de MontréalCegep de Saint Hyacinthe
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetritisHerdBacteriologyDairy cattleVeterinary medicineAnimal sciencePopulationEscherichia coliBiologyMedicineIce calvingPregnancyLactationBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objectives of this study were to validate the performance of on-farm bacteriological culture systems for identification of Escherichia coli in the uterus of early postpartum dairy cows and to determine if an association is present between the results and the subsequent occurrence of puerperal metritis (PM). A prospective cohort study was conducted in one commercial Holstein dairy herd in which 400 cows were sampled between 24 and 48 h after parturition. Three bacteriological samples were obtained from the uterus of each cow and were cultured for identification of E. coli. One sample was cultured in a commercial bacteriology laboratory according to standard procedures for identification of E. coli and was considered as the reference test. The two other samples were cultured on the farm using the Tri-Plate (University of Minnesota, St. Paul, MN) and Petrifilm systems, and plate readings were done after 24 and 48 h of incubation (variables: Tri24h, Tri48h, Petri24h, Petri48h). Participating cows were followed until 21 days in milk to diagnose PM. The prevalence of PM and E. coli (from the reference test) in the cow population was 15.0 and 33.5%, respectively. Both on-farm culture systems were accurate compared with the reference test. The sensitivity and specificity were 97 and 100%, 99 and 100%, 100 and 92%, and 100 and 89% for Tri24h, Tri48h, Petri24h, and Petri48h, respectively. On-farm results for Tri24h, Tri48h, Petri24h, and Petri48h were associated with subsequent occurrence of PM. The results from this study support the use of the Tri-Plate and Petrifilm culture systems on dairy farms to identify the presence of E. coli in the uterus of postpartum cows.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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