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Enregistrement W2588905998 · doi:10.1038/srep42603

A screening strategy for the discovery of drugs that reduce C/EBPβ-LIP translation with potential calorie restriction mimetic properties

2017· article· en· W2588905998 sur OpenAlexfundno aff
Mohamad Amr Zaini, Christine Müller, Tobias Ackermann, Jeanette Reinshagen, Gertrud Kortman, Ole Pleß, Cornelis F. Calkhoven

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMcGill UniversityHarvard University
Mots-clésmTORC1Upstream open reading frameTranslation (biology)Calorie restrictionBiologyTranscription factorCell biologyOpen reading frameMessenger RNABiochemistryGeneSignal transductionEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An important part of the beneficial effects of calorie restriction (CR) on healthspan and lifespan is mediated through regulation of protein synthesis that is under control of the mechanistic target of rapamycin complex 1 (mTORC1). As one of its activities, mTORC1 stimulates translation into the metabolic transcription factor CCAAT/Enhancer Binding Protein β (C/EBPβ) isoform Liver-specific Inhibitory Protein (LIP). Regulation of LIP expression strictly depends on a translation re-initiation event that requires a conserved cis-regulatory upstream open reading frame (uORF) in the C/EBPβ-mRNA. We showed before that suppression of LIP in mice, reflecting reduced mTORC1-signaling at the C/EBPβ level, results in CR-type of metabolic improvements. Hence, we aim to find possibilities to pharmacologically down-regulate LIP in order to induce CR-mimetic effects. We engineered a luciferase-based cellular reporter system that acts as a surrogate for C/EBPβ-mRNA translation, emulating uORF-dependent C/EBPβ-LIP expression under different translational conditions. By using the reporter system in a high-throughput screening (HTS) strategy we identified drugs that reduce LIP. The drug Adefovir Dipivoxil passed all counter assays and increases fatty acid β-oxidation in a hepatoma cell line in a LIP-dependent manner. Therefore, these drugs that suppress translation into LIP potentially exhibit CR-mimetic properties.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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