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Enregistrement W2588933643 · doi:10.1093/neuonc/now212.475

MPTH-38. TRANSFORMING GROWTH FACTOR-BETA GENE EXPRESSION AS A NEW PROGNOSTIC BIOMARKER FOR GLIOBLASTOMA

2016· article· en· W2588933643 sur OpenAlexaff
Laurent-Olivier Roy, Marie-Belle Poirier, Marie Blanchette, David Fortin

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTGF-β signaling in diseases
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene isoformBiomarkerDownregulation and upregulationHazard ratioGlioblastomaPhenotypeProportional hazards modelMedicineTransforming growth factorOncologyTransforming growth factor betaCancer researchInternal medicineImmunohistochemistryMultivariate analysisPathologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glioblastoma (GBM) is the most common and aggressive malignant primary brain tumour in adults. Response to standard therapy is transitory, recurrence is inevitable and patients median overall survival is inferior to 15 months. The GBM phenotype is characterized by anarchic proliferation and invasiveness together with radio-/chemoresistance abilities. These features are strongly upregulated by transforming growth factor-beta (TGF-b). Therefore, we hypothesized that TGF-b gene expression could correlate with GBM patients overall survival (OS) and be utilized as a prognostic biomarker. Using targeted qPCR, we investigated the expression of TGF-b1 and -b2 in 159 GBM specimens harvested during surgery and 18 non-tumoral brain tissue. We found that both isoforms were significantly upregulated in GBM tumours (33- and 11-fold respectively). While TGF-b1 was the dominant isoform in newly diagnosed tumours (2-fold), no significant difference was observed in recurrent GBMs. Furthermore, TGF-b1 expression levels significantly correlated with OS and progression-free survival (PFS) in newly diagnosed patients. Indeed, multivariate analysis (Cox model) using expression levels as well as numerous clinical surrogates, revealed that high and moderate TGF-β1 expressing patients had a much poorer prognosis than the low TGF-β1 expressing tumours (hazard ratio [95% CI] was 1.998 [1.103 - 3.620]; p=0.022). Interestingly, at recurrence, neither isoforms had meaningful influence on clinical surrogates. In this study we show that TGF-b1 is the prevailing isoform in newly diagnosed GBM rather than the previously recognized TGF-b2. To our knowledge, this study is the first to reveal a significant correlation between TGF-b1 gene expression and OS or PFS in newly diagnosed GBM. Therefore, we believe that TGF-b1 could be used as a prognostic biomarker and/or target which could influence treatment planning and clinical followup of GBM patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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