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Enregistrement W2589027510 · doi:10.1073/pnas.1621436114

p53 regulates the cardiac transcriptome

2017· article· en· W2589027510 sur OpenAlexafffund
Tak W. Mak, Ludger Hauck, Daniela Grothe, Filio Billia

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensHeart and Stroke FoundationUniversity of TorontoUniversity Health NetworkToronto General HospitalPrincess Margaret Cancer CentreOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of Canada
Mots-clésTranscriptomeBiologyGeneRegulatorEpigeneticsTranscription factorGene expressionRegulation of gene expressionCell biologyGene regulatory networkGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The tumor suppressor Trp53 (p53) inhibits cell growth after acute stress by regulating gene transcription. The mammalian genome contains hundreds of p53-binding sites. However, whether p53 participates in the regulation of cardiac tissue homeostasis under normal conditions is not known. To examine the physiologic role of p53 in adult cardiomyocytes in vivo, Cre-loxP-mediated conditional gene targeting in adult mice was used. Genome-wide transcriptome analyses of conditional heart-specific p53 knockout mice were performed. Genome-wide annotation and pathway analyses of >5,000 differentially expressed transcripts identified many p53-regulated gene clusters. Correlative analyses identified >20 gene sets containing more than 1,000 genes relevant to cardiac architecture and function. These transcriptomic changes orchestrate cardiac architecture, excitation-contraction coupling, mitochondrial biogenesis, and oxidative phosphorylation capacity. Interestingly, the gene expression signature in p53-deficient hearts confers resistance to acute biomechanical stress. The data presented here demonstrate a role for p53, a previously unrecognized master regulator of the cardiac transcriptome. The complex contributions of p53 define a biological paradigm for the p53 regulator network in the heart under physiological conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,275
Score d'incertitude au seuil0,610

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations130
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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