The impact of PBRM1 and BAP1 expression on outcomes of patients with metastatic renal cell carcinoma (mRCC) treated with VEGF-targeted therapy (TT).
Notice bibliographique
Résumé
616 Background: Polybromo-1 (PBRM1) and BRCA1 associated protein-1 (BAP1) are genes commonly mutated in clear cell RCC (ccRCC) and have been associated with clinical outcome. This work aims to evaluate the impact of PBRM1 and BAP1 expression by IHC in mRCC patients treated with VEGF-TT. Methods: PBRM1 and BAP1 expression was evaluated by IHC in a TMA including 146 mRCC patients. PBRM1 and BAP1 IHC scores were dichotomized as a binary variable: negative (-) or positive (+) (weak positivity was excluded). The associations of PBRM1 or BAP1 expression with baseline clinico-pathological characteristics were evaluated, as well as with overall survival (OS) and time to treatment failure (TTF) usingCox proportional hazards models. Results: Out of 146 patients, 116 and 109 samples had available results for PBRM1 and BAP1 staining, respectively. Overall, 90% (n = 131) patients had ccRCC. 70/116 samples (60%) were PBRM1- and 26/109 patients (24%) were BAP1-. Only 12% (n = 13) of patients had simultaneous negative PBRM1 and BAP1. While there was no association between PBRM1 expression status and clinical factors, BAP1- samples were associated with poor IMDC prognostic risk score (p = 0.004) and higher Fuhrman grade (p = 0.012). PBRM1+ patients showed a trend towards an increased risk of death and a shorter TTF compared to PBRM1- patients (OS: HR = 1.38, 95%CI: 0.92-2.07, p = 0.1; TTF: HR = 1.39, 95%CI: 0.94-2.06, p = 0.1). BAP1 expression was not independently associated with OS or TTF. Conclusions: Loss of PBRM1, but not BAP1 expression showed a trend towards longer TTF and OS in mRCC patients treated with VEGF-TT.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».