Prognostic value of copy-number alterations of the Cohesin complex in intermediate-risk prostate cancer recurrence.
Notice bibliographique
Résumé
49 Background: The Cohesin complex plays a critical role in mitotic progression and post-replicative DNA damage repair. It serves to bring together sister chromatids both in metaphase and in homologous recombination repair following ionizing radiation. The complex has also been shown to be phosphorylated in the ATM/BRCA1 pathway. The expression of various proteins in the complex are dysregulated in many cancers: breast, prostate, etc. Interestingly, in breast cancer cell lines, Cohesin is required for MYC activation in response to estrogen. Our study sought to correlate copy number alterations in this pivotal complex with biochemical relapse in prostate cancer patients. Methods: Our cohort consists of 284 patients with D’ Amico-classified intermediate-risk prostate cancer, treated with image-guided radiotherapy (IGRT, N = 143) or radical prostatectomy (RadP, N = 141). Pre-treatment biopsies and prostatectomy samples were analyzed using the Affymetrix Oncoscan array. The Phoenix and AUA criteria was used to define biochemical relapse for RadP and IGRT patients respectively. Results: Copy number alterations of RAD21, SMC1B, and STAG1 were observed in 18% (n = 52), 6.3% (n = 18), and 12% (n = 35) of the cohort respectively. They were predominantly losses in SMC1B, but gains in RAD21 and STAG1. All three genes in the Cohesin complex were associated with increased risk of biochemical relapse: RAD21 on chromosome 8 (HR = 1.93, 95% CI 1.23, 3.02, Wald’s p = 0.004), SMC1B on chromosome 22 (HR = 3.37, 95% CI 1.91, 5.94, Wald’s p < 10-4), and STAG1 on chromosome 3 (HR = 1.74, 95% CI 1.04, 2.89, Wald’s p < 0.05). However, when controlled for percent genome alteration and pre-treatment serum PSA levels, only copy number loss of SMC1B was a significant predictor of biochemical relapse (HR = 2.95, 95% CI 1.62, 5.38, Wald’s p < 10-3). Conclusions: We identified a novel association of copy-number alterations in members of the Cohesin complex with biochemical recurrence following radical prostatectomy or image-guided radiotherapy. This points to the central role of Cohesin in cell-cycle and DNA damage pathways promoting prostate cancer progression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».