Quantitative weight of evidence to assess confidence in potential modes of action
Notice bibliographique
Résumé
The evolved World Health Organization/International Programme on Chemical Safety mode of action (MOA) framework provides a structure for evaluating evidence in pathways of causally linked key events (KE) leading to adverse health effects. Although employed globally, variability in use of the MOA framework has led to different interpretations of the sufficiency of evidence in support of hypothesized MOAs. A proof of concept extension of the MOA framework is proposed for scoring confidence in the supporting data to improve scientific justification for MOA use in characterizing hazards and selecting dose-response extrapolation methods for specific chemicals. This involves selecting hypothesized MOAs, and then, for each MOA, scoring the weight of evidence (WOE) in support of causality for each KE using evolved Bradford Hill causal considerations (biological plausibility, essentiality, dose-response concordance, consistency, and analogy). This early proof of concept method is demonstrated by comparing two potential MOAs (mutagenicity and peroxisome proliferator activated receptor-alpha) for clofibrate, a rodent liver carcinogen. Quantitative confidence scoring of hypothesized MOAs is shown to be useful in characterizing the likely operative MOA. To guide method refinement and future confidence scoring for a spectrum of MOAs, areas warranting further focus and lessons learned, including the need to incorporate a narrative discussion of the weights used in the evaluation and an overall evaluation of the plausibility of the outcome, are presented.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,265 | 0,629 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,004 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,006 | 0,008 |
| Bibliométrie | 0,037 | 0,015 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,006 |
| Communication savante | 0,012 | 0,009 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,008 |
| Intégrité de la recherche | 0,005 | 0,009 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».