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Enregistrement W2589875191 · doi:10.1002/mds.26913

Biomarker‐driven phenotyping in Parkinson's disease: A translational missing link in disease‐modifying clinical trials

2017· review· en· W2589875191 sur OpenAlexaff
Alberto J. Espay, Michael A. Schwarzschild, Caroline M. Tanner, Hubert H. Fernandez, David K. Simon, James B. Leverenz, Aristide Merola, Alice Chen‐Plotkin, Patrik Brundin, Marcelo Kauffman, Roberto Erro, Karl Kieburtz, Daniel Woo, Eric A. Macklin, David G. Standaert, Anthony E. Lang

Notice bibliographique

RevueMovement Disorders · 2017
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensToronto Western HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental Health
Mots-clésBiomarkerDiseaseSubtypingClinical trialParkinson's diseaseNeuroprotectionPrecision medicineNeuroscienceMechanism (biology)Biomarker discoveryMedicineBioinformaticsPsychologyBiologyPathologyComputer scienceGeneticsProteomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Past clinical trials of putative neuroprotective therapies have targeted PD as a single pathogenic disease entity. From an Oslerian clinicopathological perspective, the wide complexity of PD converges into Lewy bodies and justifies a reductionist approach to PD: A single-mechanism therapy can affect most of those sharing the classic pathological hallmark. From a systems-biology perspective, PD is a group of disorders that, while related by sharing the feature of nigral dopamine-neuron degeneration, exhibit unique genetic, biological, and molecular abnormalities, which probably respond differentially to a given therapeutic approach, particularly for strategies aimed at neuroprotection. Under this model, only biomarker-defined, homogenous subtypes of PD are likely to respond optimally to therapies proven to affect the biological processes within each subtype. Therefore, we suggest that precision medicine applied to PD requires a reevaluation of the biomarker-discovery effort. This effort is currently centered on correlating biological measures to clinical features of PD and on identifying factors that predict whether various prodromal states will convert into the classical movement disorder. We suggest, instead, that subtyping of PD requires the reverse view, where abnormal biological signals (i.e., biomarkers), rather than clinical definitions, are used to define disease phenotypes. Successful development of disease-modifying strategies will depend on how relevant the specific biological processes addressed by an intervention are to the pathogenetic mechanisms in the subgroup of targeted patients. This precision-medicine approach will likely yield smaller, but well-defined, subsets of PD amenable to successful neuroprotection. © 2017 International Parkinson and Movement Disorder Society.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,119
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,100
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,119
Score d'incertitude au seuil0,630

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1190,100
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,005
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0060,009
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0060,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,297
Tête enseignante GPT0,477
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations183
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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