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Enregistrement W2590117034 · doi:10.1200/jco.2013.31.4_suppl.395

Association of tissue factor pathway inhibitor gene polymorphism -33T→C with disease-free survival in colorectal cancer.

2013· article· en· W2590117034 sur OpenAlexaff
Amy Bazzarelli, Adena Scheer, Lee‐Hwa Tai, Rashmi Seth, Christiano Tanese de Souza, Derek J. Jonker, Jean A. Maroun, Marc Carrier, Rebecca A. Auer

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineGenotypeTissue factor pathway inhibitorColorectal cancerInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismGastroenterologyProportional hazards modelHazard ratioFactor VFactor V LeidenOncologyCancerTissue factorGeneBiologyThrombosisVenous thrombosisGeneticsCoagulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

395 Background: Tissue Factor Pathway Inhibitor (TFPI) is an anticoagulant protein exhibiting antimetastatic properties in preclinical models. The homozygous CC polymorphism on intron 7 of TFPI (-33T-->C) is associated with higher TFPI protein levels and a lower risk of venous thromboembolism (VTE). The present study is the first to evaluate the impact of the inherited TFPI polymorphism on disease-free survival (DFS) in cancer patients following curative resection. Methods: A prospectively maintained colorectal tumour bank with associated clinical data was used to identify patients who underwent curative surgery for colorectal cancer between 1994 and 2006. Germline DNA was extracted from formalin fixed, paraffin embedded normal colonic mucosa. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) for Tissue Factor Pathway Inhibitor (TFPI, -33T-->C), Factor V Leiden (FVL, G1691A), and Prothrombin (PT, G20210A) were determined by polymerase chain reaction. DFS was described using the Kaplan-Meier method. Multivariable regression analysis, with known prognostic factors, was performed using the Cox Proportional Hazard model. Results: Of the 139 patients identified, the prevalence of the wildtype (TT) TFPI genotype was found in 57.3% of samples, the heterozygous genotype (TC) in 29.4%, and the homozygous genotype (CC) in 10.5%. The incidence of VTE was 21.6% in the TT/TC genotypes and 6.7% in the CC genotype (p=0.4). The CC genotype was associated with superior DFS (HR 0.38, [95%CI 0.17-0.88]; p=.02) with 5 year DFS 56.3% vs. 24.6% for CC vs. TT/TC respectively. In multivariate analysis female sex (HR=0.61, p=.02), chemotherapy (HR=0.66, p=.05), node negative (HR=0.47, p=.005) and TFPI CC polymorphism (HR=0.35, p=.01) were independently associated with improved DFS. The prevalence of FVL (0.7%) and PT (2.2%) polymorphisms was too low to detect any interaction with TFPI polymorphism and DFS. Conclusions: These findings indicate that the inherited anticoagulant homozygous -33T-->C TFPI polymorphism may protect against colon cancer recurrence, and suggest a causal role for the coagulation system in cancer outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,421
Écart entre enseignants0,377 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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