MicroRNA polymorphisms and esophageal cancer outcome.
Notice bibliographique
Résumé
32 Background: Better understanding of the biology of esophageal cancer may help improve its treatment. MicroRNAs (miRs) regulate mRNA and can exert some influence on carcinogenesis. Identification of the microRNAs which regulate esophageal cancer development could potentially yield alternative therapeutic options. Objectives: We evaluated polymorphisms in miRs, miR biogenesis, binding sites of miR and their role in the survival of esophageal cancer patients. Methods: 324 esophageal cancer patients of all stages and histological subtypes were evaluated. Using Illumina Custom GoldenGate, 43 polymorphisms in miR pathways were evaluated. Cox proportional hazards models adjusted for clinical prognostic variables and determined the association of polymorphisms with overall survival (OS) and progression free survival (PFS). Adjusted hazard ratio (aHR) and 95% confidence intervals (CI) were calculated. Results: Among our patients, 83% were male while the mean age was 65 years. 73% had adenocarcinomas while 33.6% had advanced tumors (Stage IV). The median PFS was 1.20 years, while median OS was 2.17 years. After adjustment for clinical variables, a 5’UTR polymorphism in pri-mir26a-1 (rs7372209) was significantly associated with reduced PFS [aHR=0.78, CI:0.62-0.98, p=0.04] and OS [aHR 0.71 (0.56-0.89), p=0.003]. Three other polymorphisms were significantly associated with OS but not PFS: these included two polymorphisms of miR processing genes, DDX20 (rs197412) [aHR 1.31 (1.04-1.64), p=0.02] and EIF2C1 (rs595961) [aHR 0.76 (0.60-0.97), p=0.03] as well as the CD86 3’UTR C>G (rs17281995) polymorphism, which has been predicted to affect the binding of miR337, miR582, miR200a, miR184, and miR212 [aHR 1.38 (1.03-1.85), p=0.03]. Conclusions: We report the initial association of miR related polymorphisms with survival in esophageal cancer. We plan to explore additional relationships and validate these findings in other datasets.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».