Validation of a genomic classifier that predicts metastatic disease progression in men with biochemical recurrence post radical prostatectomy.
Notice bibliographique
Résumé
5033 Background: Almost 50,000 men per year will present with biochemical recurrence (BCR) following local treatment for prostate cancer. These men with rising PSAs as the lone indicator of recurrence present a management dilemma due to their varied outcomes with only a proportion developing subsequent metastatic disease. Thus, there is a clear need to improve patient risk stratification in this context. Here, we evaluate Decipher, a genomic classifier (GC) in men with BCR following radical prostatectomy (RP) for its ability to predict metastasis. Methods: The 22-marker GC was validated in a prospectively designed case-cohort study of 1,010 clinically high-risk RP patients. 219 patients, including 85 who developed BCR at least 6 months post-RP were subjected to microarray analysis and GC scores were generated. Survival ROC curves, weighted Cox proportional hazards, and decision curves were used to compare the performance of the GC to Gleason score (GS), PSA doubling time (PSAdT) and time to BCR (ttBCR). Results: GC scores significantly stratified these men into those who would or would not develop metastasis after BCR (8% versus 40% of patients developed metastasis at 3 years following BCR depending on GC score category, p<0.001). The AUC for GC was 0.82 (95% CI, 0.76-0.86), compared to that of GS 0.64 (0.58-0.70), PSAdT 0.69 (0.61-0.77) and ttBCR 0.52 (0.46-0.59). In decision curve analysis, the GC had the highest overall ‘net benefit’ and in multivariable modeling with clinicopathologic variables, only GC (p=0.006) and GS (p=0.046) scores were significant predictors of metastasis. Conclusions: When compared to clinicopathologic variables, the GC better predicted metastatic progression among men with BCR following RP. While confirmatory studies in additional patient populations are required, these results suggest that use of the GC can allow for better selection of men requiring additional treatment at the time of BCR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».