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Enregistrement W2590455134 · doi:10.1172/jci91211

Targeting PPARγ in the epigenome rescues genetic metabolic defects in mice

2017· article· en· W2590455134 sur OpenAlexaff
Raymond E. Soccio, Zhenghui Li, Eric R. Chen, Yee Hoon Foong, Kiara K. Benson, Joanna R. DiSpirito, Shannon E. Mullican, Matthew J. Emmett, Erika R. Briggs, Lindsey C. Peed, Richard K. Dzeng, Carlos J. Medina, Jennifer F. Jolivert, Megan Kissig, Satyajit Rajapurkar, Manashree Damle, Hee‐Woong Lim, Kyoung‐Jae Won, Patrick Seale, David J. Steger, Mitchell A. Lazar

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensInstitute of Nutrition, Metabolism and Diabetes
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthJPB FoundationNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesUniversity of Pennsylvania
Mots-clésRosiglitazoneEndocrinologyInternal medicineEpigenomeInsulin resistanceAdipose tissueWhite adipose tissueBiologyPRDM16AdipocyteEpigenomicsInsulinGene expressionGeneGeneticsMedicineDNA methylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Obesity causes insulin resistance, and PPARγ ligands such as rosiglitazone are insulin sensitizing, yet the mechanisms remain unclear. In C57BL/6 (B6) mice, obesity induced by a high-fat diet (HFD) has major effects on visceral epididymal adipose tissue (eWAT). Here, we report that HFD-induced obesity in B6 mice also altered the activity of gene regulatory elements and genome-wide occupancy of PPARγ. Rosiglitazone treatment restored insulin sensitivity in obese B6 mice, yet, surprisingly, had little effect on gene expression in eWAT. However, in subcutaneous inguinal fat (iWAT), rosiglitazone markedly induced molecular signatures of brown fat, including the key thermogenic gene Ucp1. Obesity-resistant 129S1/SvImJ mice (129 mice) displayed iWAT browning, even in the absence of rosiglitazone. The 129 Ucp1 locus had increased PPARγ binding and gene expression that were preserved in the iWAT of B6x129 F1-intercrossed mice, with an imbalance favoring the 129-derived alleles, demonstrating a cis-acting genetic difference. Thus, B6 mice have genetically defective Ucp1 expression in iWAT. However, when Ucp1 was activated by rosiglitazone, or by iWAT browning in cold-exposed or young mice, expression of the B6 version of Ucp1 was no longer defective relative to the 129 version, indicating epigenomic rescue. These results provide a framework for understanding how environmental influences like drugs can affect the epigenome and potentially rescue genetically determined disease phenotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,410
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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