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Enregistrement W2590572220 · doi:10.2323/jgam.2016.08.002

Effect of <i>Ageratina adenophora</i> invasion on the composition and diversity of soil microbiome

2017· article· en· W2590572220 sur OpenAlexaff
Yunhong Kong, James Kong, Dingkang Wang, Heping Huang, Yonxia Wang, Yun Xia

Notice bibliographique

RevueThe Journal of General and Applied Microbiology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyAcidobacteriaActinobacteriaWeedBotanyVerrucomicrobiaMicrobiomeBiodiversityDominance (genetics)PlanctomycetesPopulationEcologyBacteria16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the present study, high throughput 16S rRNA gene sequencing was used to investigate soil invaded by the aggressive weed Ageratina adenophora to determine its effect on the species composition, distribution, and biodiversity of the bacterial communities. Soil samples from 12 micro-sites containing a monoculture of A. adenophora plants, mixtures of A. adenophora and different native plant species, and native species alone were studied. We found that the invasion of this weed resulted in a selection of bacteria belonging to phyla Acidobacteria and Verrucomicrobia and the lack of bacteria belonging to phyla Actinobacteria and Planctomycetes, but did not affect significantly the percentage abundances of members of other phyla. A similar bacterial population selection was also observed at genus or subgroup levels. The NO3–-N level was an important factor affecting soil bacterial communities and contributed to the dominance of A. adenophora. However, the numbers of total bacterial species, and the diversity and structure of soil bacterial microbiome did not (P > 0.05) change significantly following invasion by this weed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,057
Score d'incertitude au seuil0,505

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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