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Enregistrement W2590708113 · doi:10.1038/bjc.2017.28

Discrepancies in central review re-testing of patients with ER-positive and HER2-negative breast cancer in the OPTIMA prelim randomised clinical trial

2017· article· en· W2590708113 sur OpenAlexaff
Sarah E. Pinder, Alexander Campbell, John M.S. Bartlett, Andrea Marshall, David W. Allen, Mary Falzon, Janet Dunn, Andreas Makris, Luke Hughes‐Davies, Robert C. Stein

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Cancer · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensInstitute of Cancer ResearchOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesHealth Technology Assessment ProgrammeUniversity College LondonNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésMedicineBreast cancerOncologyInternal medicineHuman Epidermal Growth Factor Receptor 2CancerConfidence intervalClinical trialGynecology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: There is limited data on results of central re-testing of samples from patients with invasive breast cancer categorised in their local hospital laboratories as oestrogen receptor (ER) positive and human epidermal growth factor receptor homologue 2 (HER2) negative. METHODS: The Optimal Personalised Treatment of early breast cancer usIng Multiparameter Analysis preliminary study (OPTIMA prelim) was the feasibility phase of a randomised controlled trial to validate the use of multiparameter assay-directed chemotherapy decisions in the UK National Health Service (NHS). Eligibility criteria included ER positivity and HER2 negativity. Central re-testing of receptor status was mandatory. RESULTS: Of the 431 patients tested centrally, discrepant results between central and local laboratory results were identified in only 19 (4.4%; 95% confidence interval 2.5-6.3%) patients (with 21 tumours). On central review, seven patients had cancers that were ER-negative (1.6%) and 13 (3.0%) patients with 15 tumours had HER2-positive disease, including one tumour discrepant for both biomarkers. CONCLUSIONS: Central re-testing of receptor status of invasive breast cancers in the UK NHS setting shows a high level of reproducibility in categorising tumours as ER-positive and HER2-negative, and raises questions regarding the cost effectiveness and clinical value of central re-testing in this sub-group of breast cancers in this setting.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,157
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,235
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,157
Score d'incertitude au seuil0,832

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1570,235
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,005
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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