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Enregistrement W2591169367 · doi:10.1038/s41598-017-07488-y

Low-dose cryo electron ptychography via non-convex Bayesian optimization

2017· article· en· W2591169367 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueAdvanced X-ray Imaging Techniques
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMax-Planck-GesellschaftInternational Max Planck Research School for Environmental, Cellular and Molecular Microbiology
Mots-clésPtychographyPhase retrievalResolution (logic)OpticsZernike polynomialsElectron microscopeImage resolutionPhase problemMaterials sciencePhysicsComputer scienceBiological systemFourier transformArtificial intelligenceDiffractionBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Electron ptychography has seen a recent surge of interest for phase sensitive imaging at atomic or near-atomic resolution. However, applications are so far mainly limited to radiation-hard samples, because the required doses are too high for imaging biological samples at high resolution. We propose the use of non-convex Bayesian optimization to overcome this problem, and show via numerical simulations that the dose required for successful reconstruction can be reduced by two orders of magnitude compared to previous experiments. As an important application we suggest to use this method for imaging single biological macromolecules at cryogenic temperatures and demonstrate 2D single-particle reconstructions from simulated data with a resolution up to 5.4 Å at a dose of 20 e − /Å 2 . When averaging over only 30 low-dose datasets, a 2D resolution around 3.5 Å is possible for macromolecular complexes even below 100 kDa. With its independence from the microscope transfer function, direct recovery of phase contrast, and better scaling of signal-to-noise ratio, low-dose cryo electron ptychography may become a promising alternative to Zernike phase-contrast microscopy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,922
Score d'incertitude au seuil0,849

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle