Investigation of Vancomycin-Resistant Enterococci and The Distribution of The Vancomycin Resistance Associated Genes in Chickens
Notice bibliographique
Résumé
In this study, chicken litter and cloacal swabs (n=300) were investigated for the detection of vancomycin-resistant enterococci and determination of resistance associated genes. The samples were cultured in Enterococcocel broth and on Enterococcocel agar. One hundred seven presumptive isolates were examined by PCR at the genus level. For the determination of vancomycin resistance of Enterococcus spp. isolates (n=98), disc diffusion and macro dilution methods were performed. According to disc diffusion test, 49 isolates were resistant and 48 were intermediate and according to the macro-dilution tests, 5 of the isolates were found to be resistant (MIC≥64 μg/ml), 83 of them were intermediate (MIC = 8-16 μg/ml) and 9 of them susceptible (MIC≤4 μg/ml). Vancomycin resistant and intermediate isolates were examined for detection of MIC value for teicoplan (n=88); 2 were resistant (MIC≥32 μg/ml) and 86 susceptible (MIC≤8 μg/ml). Finally, vancomycin resistant and intermediate isolates were examined by PCR for the detection of vancomycin resistance associated genes and identification at species level by PCR. As a result of PCR, 5 of the isolates were vanA gene carrying E. faecium , 29 were E. gallinarum with vanC1 gene and 54 were E. casseliflavus with vanC2 /3 gene.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».