Differential overall survival (OS) results in RECORD-3 study based on three distinct mRCC molecular subgroups classified by BAP1 and/or PBRM1 mutations.
Notice bibliographique
Résumé
561 Background: PBRM1 and BAP1, both of which encode chromatin modulating proteins, have recently been identified as frequently mutated tumor suppressor genes in RCC. However, their correlation with outcomes of targeted therapies is unknown. We explored correlations between overall survival (OS) and mutations in archival tumor samples from RECORD-3, a randomized phase 2 trial comparing first-line everolimus (EVE) then sunitinib (SUN) to first-line SUN then EVE at progression in 471 treatment-naïve mRCC patients (J Clin Oncol 2014; 32:2764). Methods: Somatic mutations in exons of 341 cancer related genes were identified by a next generation sequencing (NGS) assay (MSK IMPACT). Association between genotypes and OS was assessed by Cox PH models and log-rank tests. Results: DNA of 258 archival tumor and 181 matched germline samples was successfully analyzed (median coverage 530X). Three molecular subgroups Gr1 (BAP1 MT [mutant], PBRM1 WT [wild-type]/MT; 17.4%), Gr2 (PBRM1 MT, BAP1 WT; 38.4%), and Gr3 (PBRM1 WT, BAP1 WT; 44.2%) with different OS outcomes after sequential EVE-SUN or SUN-EVE were identified (Table). In the sequential EVE-SUN arm, median OS (months) was shortest with Gr1 (9.8; 95% CI, 7.8–20.0), longest with Gr2 (39.6; 95% CI, 31.7–not estimable), and intermediate with Gr3 (18.1; 13.7–30.0), whereas in the SUN-EVE arm there was no significant difference among groups. When comparing OS between treatment sequences within molecular groups, a trend suggested differences for EVE-SUN vs SUN-EVE in Gr1 (HR 1.5), Gr2 (0.8), and Gr3 (1.2), although comparisons were not statistically significant. Conclusions: Our results suggest that these genotypes may represent distinct RCC molecular subtypes with potentially different predictive/prognostic values on targeted therapies. Different treatment sequences may be considered depending on the genotypes. Clinical trial information: NCT00903175. [Table: see text]
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».