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Enregistrement W2591513328 · doi:10.1200/jco.2013.31.6_suppl.463

Involvement of miRNAs in the formation and maintenance of self-renewing kidney cancer spheres with stem cell properties.

2013· article· en· W2591513328 sur OpenAlexaff
Zsuzsanna Lichner, Carol Saleh, Venkateshwaran Subramaniam, Gerard J. Prud'homme, George M. Yousef

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCD44Cancer stem cellCancer researchClonogenic assayProgenitor cellmicroRNAMesenchymal stem cellStem cellCancer cellStem cell markerCancerBiologyCell cultureCellCell biologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

463 Background: Cancer cells may acquire stem cell (CSC) properties by activated TGFβ-epithelial-mesenchymal transition (EMT) axis resulting in formation of cancer stem cells. miRNAs are involved in CSC formation in solid tumors, but their role has not been investigated in renal cell carcinoma (RCC). Methods: RCC spheres were generated and propagated in serum-free defined medium (SFDM). mRNA expression was assessed by qRT-PCR. miRNA expression was screened on a qRT-PCR based panel. Tumorigenicity was assessed by subcutaneous injection of RCC sphere or parental cells into immunodeficient mice in different dilutions. TargetScan and miRPath was used for target prediction and clustering. Results: We isolated self-renewing cancer spheres from ACHN and CAKI-1 RCC cell lines in the stem cell supporting media, SFDM. Spheres were highly clonogenic and tumorigenic in xenograft tumor model and expressed high levels of stem cell-related markers and mesenchymal markers. These spheres were enriched in the mesenchymal marker CD44 and the kidney progenitor maker CD24 indicating that EMT contributed to their formation or maintenance. We compared miRNA expression between the spheres and the parental cells and identified differentially expressed miRNAs. Functional clustering of their predicted targets indicates that TGFβ signaling is a potential regulator of CSC self-renewal and is regulated by the candidate miRNAs. Further, we show that transfection of ACHN and CAKI-1 cells with the miR-17 inhibitor resulted in rapid and highly efficient formation of cancer spheres that were indistinguishable from the spheres formed in SFDM. These spheres were stable and could be propagated indefinitely. Histologic examination and immunohistochemistry of the sphere-derived xenografts confirmed the presence of clear cell RCC with large areas of sarcomatoid dedifferentiation. Finally, we prove that the TGFβ receptor II, and the co-Smad Smad4 are possible direct targets of miR-17. Conclusions: The TGFβ-EMT axis likely contributes to the self-renewing potential of RCC spheres. miRNAs are differentially expressed in RCC spheres and miR-17 inhibition transformed ccRCC cells to highly tumorigenic RCC spheres.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,109
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
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