Abstract 500: Assessing the Impact of Cardiovascular Disease-Related Genetic Variation on Clinical Cognitive Impairment
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: “Cognitive impairment, no dementia” (CIND) is a prodromal stage of cognitive decline which marks the onset of dementia and is due most commonly to 1) Alzheimer disease (AD) or 2) vascular dysfunction. In order to assess the genetic component of CIND susceptibility, we investigated cardiovascular disease (CVD) and AD-associated genetic variation in CIND patients, hypothesizing that the genetic variation affecting CVD and AD susceptibility is also associated with CIND susceptibility. Methods: Our study cohort was taken from the Canadian Study of Health and Aging (CSHA) and was comprised of patients >65 years old with CIND (n=274) and matched normal controls (n=301). We genotyped ∼200,000 CVD-related SNPs using the Cardio-Metabochip genotyping array (Illumina). We also genotyped a panel of the top 11 AD-associated single nucleotide polymorphisms (SNPs) and APOE isotype. We tested for association between CIND status and genotypes using a logistic regression model adjusted for appropriate covariates. Genetic risk scores (GRSs) evaluated associations between CIND status and the accumulation of multiple genetic markers. Results: From our Cardio-Metabochip analysis, we identified 5 novel CIND susceptibility loci, with rs16901621 in FLJ22536 as our most significantly associated SNP (P=1.05E-06, OR=2.51, 95%CI=1.73-3.63). APOE ε4 isotype was modestly associated with CIND status (P<0.05), while AD SNP risk alleles were not associated (P>0.1). Conclusion: Using a high-throughput CVD microarray, we found novel genetic markers for CIND approaching genome-wide levels of significance. In contrast, known genetic markers for AD, such as APOE ε4 showed only modest associations in this cohort. Follow-up of variants in a CSHA replication cohort (n=370) is currently underway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».