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Enregistrement W2591617991 · doi:10.1093/ajcp/aqw191.024

Detection of Systematic Error Using the Average of Deltas

2017· article· en· W2591617991 sur OpenAlexaff
Mark A Cervinski, George Cembrowski

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Clinical Pathology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueFault Detection and Control Systems
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStatisticsComputational biologyComputer scienceBiologyMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Traditional quality control (QC) procedures only provide a snapshot of assay performance, and as such laboratories employ alternate QC strategies to detect systematic error (SE). One strategy, the delta check, compares a patient’s most recent chemistry results to historical values. However, delta checks are best suited to detect large SE. Another strategy, moving averages (MA) monitors the mean patient analyte value to detect SE. MA, however, cannot equitably detect SE in skewed patient populations. The objective of our study was to combine the delta check and MA to develop an average of deltas (AoD) strategy that monitors the mean difference between pairs of consecutive, intrapatient results. Methods: From a database of 4.2 million results spanning 638 days, we generated arrays for each assay in our study containing pairs of patient results collected within 18-26 hours of each other. To develop sensitive AoD protocols that detect SE equal to the reference change value for each assay, we employed a simulated annealing algorithm in MatLab (Mathworks, Natick, MA) to select the number of patient pairs to average (Np) and truncation limits to eliminate large deltas. Using MatLab, we simulated SE by adding positive or negative bias at fixed intervals to the arrays of paired results for serum assays of albumin, alanine aminotransferase, alkaline phosphatase, amylase, aspartate aminotransferase, bicarbonate, bilirubin (total and direct), calcium, chloride, creatinine, lipase, sodium, phosphorus, potassium, total protein, and magnesium. For each assay the average number of deltas to detection (ANDD) was calculated in response to induced SE. Results: ANDD varied between AoD protocols assays, and protocol with the lowest ANDD was amylase with a + 20 U/L shift detected with an ANDD of 6.2 intrapatient deltas and a –20 U/L shift detected with an ANDD of 6.6. A shift of 1 mg/dL in calcium was detected with an ANDD of 6.5 and 11.9 patient pairs, respectively. Creatinine had the highest ANDD in our validation set with an ANDD of 44.6 for a + 0.3 mg/dL shift and an ANDD of 43 for a –0.3 mg/dL shift. Conclusions: We have demonstrated that the AoD rapidly detects SE. AoD is complimentary to other QC strategies such as MA in that AoD detects SE for skewed distributions such as amylase which are challenging for MA. AoD’s limitation is that repeated daily patient testing is required; however, for larger inpatient facilities, attaining sufficient numbers of repeated daily labs should not be an issue. AoD analysis as part of a middleware package would enhance detection of SE and would complement other QC strategies already employed in the clinical laboratory.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,021
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,075
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,109

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0210,075
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
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