Secondary Cytogenetic Abnormalities and Outcome in Children with TEL-AML1-Positive Acute Lymphoblastic Leukemia.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The t(12;21) translocation, which results in the fusion of the TEL (ETV6) and AML1 (RUNX1) genes, is present in ~25% of pediatric B-precusor acute lymphoblastic leukemia (ALL) patients. Although initially thought to be a favorable prognostic indicator, the t(12;21) was associated with a similar rate of relapse as t(12;21)-negative pre-B ALL in subsequent studies. While secondary cytogenetic abnormalities are often present, their prognostic significance is unknown. The objective of this study is therefore to examine the type, frequency and prognostic impact of secondary cytogenetic abnormalites in t(12;21)-positive blasts of children with ALL. We studied retrospectively 56 patients diagnosed with t(12;21)-positive ALL at the Hospital for Sick Children between 2000–2005. The mean age at diagnosis was 4.9 years (range <1 to 12 years). Nine patients (16%) presented with a white blood cell count of greater than 50 × 109/L. Cytogenetic studies consisted of a combination of FISH, G-banding and spectral karyotyping. The most frequent secondary cytogenetic changes in patients with t(12;21)-positive ALL were: the deletion of the non-translocated TEL allele (38%), an extra copy of the TEL-AML1 fusion gene (14%). Additional numerical abnormalities were seen in approximately one-third of the cases, with the most common being a gain of chromosome 21(13%). Recurrent deletions of chromosomal regions 6q and 11q were observed (14%). A surprising degree of karyotypic complexity was noted. Three or more additional chromosome abnormalities, two abnormal clonal lines, and complex structural rearrangements involving TEL-AML1 were detected in 28%, 21%, and 9% of patients, respectively. Five children (9%) in this cohort have developed a relapse of ALL. The 5-year event-free survival (EFS) was 83±7%. The 5-year EFS for patients with a deleted second TEL allele or an extra TEL-AML1 fusion was not statistically different. Of note, 4 of the children who relapsed had high-risk features at presentation (NCI criteria). All were treated with chemotherapy protocols developed for lower risk ALL. The realization that TEL-AML1 does not always predict excellent prognosis indicates that an on-going study of patients and their survival, with detailed analysis of complex genetic changes, is necessary for a reliable assessment of the prognostic value of the t(12;21) in pediatric ALL.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».