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Enregistrement W2591873411 · doi:10.1177/1098612x17695899

Comparison of real-time PCR with fungal culture for the diagnosis of <i>Microsporum canis</i> dermatophytosis in shelter cats: a field study

2017· article· en· W2591873411 sur OpenAlexaff
Linda S. Jacobson, Lauren M. McIntyre, Jenny Mykusz

Notice bibliographique

RevueJournal of Feline Medicine and Surgery · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNail Diseases and Treatments
Établissements canadiensWildlife Conservation Society Canada
Organismes subventionnairesWinn Feline Foundation
Mots-clésMicrosporum canisDermatophyteCATSCanisMicrosporumMedicineMicrobiological cultureVeterinary medicineMedical microbiologyPcr testBiologyPolymerase chain reactionMicrobiologyInternal medicineDermatologyTrichophytonAntifungal

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives Fungal culture requires at least 14 days for a final result, compared with 1-3 days for PCR. The study compared a commercial real-time dermatophyte PCR panel with fungal culture in cats in a shelter setting for: (1) diagnosis of Microsporum canis infection; and (2) determination of mycological cure. Methods This was a cross-sectional, observational study of cats with suspicious skin lesions or suspected exposure to dermatophytosis. Hair samples were collected for fungal culture and PCR prior to treatment and at weekly intervals until two negative culture results were obtained. Results One hundred and thirty-two cats were included, of which 28 (21.2%) were culture positive and 104 (78.8%) culture-negative for M canis. PCR correctly identified all culture-positive cats and 92/104 culture negative cats; there were 12 false-positive PCR results. The sensitivity and specificity of PCR were 100% (95% confidence interval [CI] 87.7-100) and 88.5% (95% CI 80.7-93.9), respectively. Data from 17 cats were available for assessment of mycological cure. At the time of the first and second negative fungal cultures, 14/17 (82.4%) and 11/17 (64.7%) tested PCR positive, respectively. Conclusions and relevance PCR showed high sensitivity and specificity for diagnosis of M canis dermatophytosis compared with fungal culture, but was unreliable for identifying mycological cure. False-positive results were relatively common. There were no false-negative PCR results and a negative PCR test was a reliable finding in this study. The ability to rapidly diagnose or rule out dermatophytosis could be a valuable tool to increase life-saving capacity in animal shelters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,266

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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