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Enregistrement W2592151663 · doi:10.1182/blood.v108.11.2539.2539

Characterization of a Hierarchy of Proliferative Ability in AML: Identification of a Role for NR2F6 in the Maintenance of the Undifferentiated State.

2006· article· en· W2592151663 sur OpenAlexaff
Christine V. Ichim, Harold Atkins, Norman N. Iscove, Richard A. Wells

Notice bibliographique

RevueBlood · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTranscription factorCell cultureCell growthCancer researchGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract AML cells are heterogeneous in their capacity to proliferate and form colonies in vitro. Determination of the genes whose expression is necessary for clonogenicity has been hindered by the inability to isolate pure populations of AML cells with defined proliferative abilities. By analyzing the growth of clonal siblings we established that the hierarchical organization of AML can be resolved into distinct strata, permitting the use of clonal siblings as biological reporters of the transcriptional signature of single cells with defined proliferative abilities. We then analyzed low passage cultures of the cell line OCI-AML4. Clones consisting of four cells were micromanipulated so that a single cell was sampled for global RT-PCR while its three clonal siblings served as reporters of clonogenicity. By microarray analysis we found the orphan nuclear receptor NR2F6 to be expressed four-fold lower in leukaemia single cells that spontaneously lose proliferative ability, compared to single cells with greater proliferative capacity. NR2F6 is a poorly characterized member of the COUP transcription factor family. We observed that NR2F6 is overexpressed in AML, CMML and MDS relative to normal bone marrow (BM). We then assessed expression of NR2F6 in U937 leukaemia cells induced to differentiate with a variety of induction agents. All differentiation agents induced significant decreases in NR2F6 expression. To characterize the effect of forced expression of NR2F6 we transduced U937 cells with a retrovirus encoding either NR2F6 or EGFP. Forced expression of NR2F6 reduced the doubling time of these populations, and inhibited retinoic acid induction of U937 cell differentiation. NR2F6 overexpressing cells did not acquire expression of the maturation marker CD11b nor were capable of reducing nitroblue tetrazolium, indicating functional maturity. Assessment of DNA content and analysis of growth kinetics revealed that NR2F6 overexpressing cells did not undergo the proliferative arrest associated with terminally differentiating U937 cells. We then investigated the role of NR2F6 in normal haematopoiesis in the C57/BL6 and Balb/c strains of mice. In both strains we observed that overexpression of NR2F6 resulted in a significant reduction in BFU-E and CFU-GM colony numbers, and colony size. These data are consistent with the notion that NR2F6 inhibits maturation of normal BM. More specifically, analysis of the immunophenotype of BM cultured in suspension for 10 days showed that NR2F6 overexpression resulted in a significant reduction in monocytes, and an increase in mast cells. An excess of mast cells was also observed in cytospin preparations of CFU-GM colonies. Additionally, we have demonstrated that overexpression of NR2F6 augments the in vitro self-renewal ability of BM, using serial replating of semi-solid cultures. Competitive BM transplantation experiments were employed to confirm the role of NR2F6 on stem cell self-renewal and differentiation in vivo. While these investigations are in progress, progenitor assays and analysis of serial-replating in all animals examined have recapitulate our ex vivo observations. Overall, these data establish the importance of NR2F6 in the regulation of normal and leukaemic haematopoietic cell self-renewal and differentiation. Furthermore, our results establish that analysis of clonal siblings allows the elucidation of differences in gene expression within the AML hierarchy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,150
Score d'incertitude au seuil0,136

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
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Résumé présentoui

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