The pesticide dieldrin disrupts proteins related to oxidative respiration and mitochondrial stress in the central nervous system
Notice bibliographique
Résumé
Quantitative proteins analysis was carried out in the hypothalamus of zebrafish following dietary exposure to the legacy pesticide dieldrin. Data were collected using iTRAQ labeling methodology and data were acquired using a hybrid quadrupole Orbitrap (Q Exactive) MS system (Thermo Fisher Scientific, Bremen, Germany). There were 3941 proteins identified in the hypothalamus of zebrafish, and these proteins comprised 23 unique expression patterns for proteins based on the three doses of dieldrin. There were 226 proteins that were regulated in one or more doses of dieldrin and 3715 proteins that were not affected. Thus, 5.7% of the proteins detected responded to the treatment. Many proteins that were differentially expressed were those found in, or associated with, the mitochondria. The proteomics data described in this article is associated with a research article, “Transcriptomic and proteomic analysis implicates the immune system and mitochondria as molecular targets of dieldrin in the zebrafish ( Danio rerio ) central nervous system” (A.M. Cowie, K.I. Sarty, A. Mercer, J. Koh, K.A. Kidd, C.J. Martyniuk, submitted) [1] , and serves as a resource for researchers working in the field of pesticide exposures and protein biomarkers.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».