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Enregistrement W2592599777 · doi:10.1101/113852

The Protein Phosphatase 4 complex promotes the Notch pathway and <i>wingless</i> transcription

2017· preprint· en· W2592599777 sur OpenAlexaff
Eric T. Hall, Tirthadipa Pradhan‐Sundd, Faaria Samnani, Esther M. Verheyen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNotch signaling pathwayBiologyWnt signaling pathwayGene knockdownPhosphataseTranscription factorCell biologyCell fate determinationHes3 signaling axisProtein phosphatase 2Signal transductionRNA interferenceNotch proteinsGeneticsGenePhosphorylationRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Wnt/Wingless (Wg) pathway controls cell fate specification, tissue differentiation and organ development across organisms. Using an in vivo RNAi screen to identify novel kinase and phosphatase regulators of the Wg pathway, we identified subunits of the serine threonine phosphatase Protein phosphatase 4 (PP4). Knockdown of the catalytic and the regulatory subunits of PP4 cause reductions in the Wg pathway targets Senseless and Distal-less. We find that PP4 regulates the Wg pathway by controlling Notch-driven wg transcription. Genetic interaction experiments identified that PP4 likely promotes Notch signaling within the nucleus of the Notch-receiving cell. Although the PP4 complex is implicated in various cellular processes, its role in the regulation of Wg and Notch pathways was previously uncharacterized. Our study identifies a novel role of PP4 in regulating Notch pathway, resulting in aberrations in Notch-mediated transcriptional regulation of the Wingless ligand. Furthermore, we show that PP4 regulates proliferation independent of its interaction with Notch. Summary statement The protein phosphatase 4 complex promotes Notch signaling and target gene expression during Drosophila wing development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,112
Score d'incertitude au seuil0,988

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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