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Enregistrement W2592730573 · doi:10.1002/cyto.b.21519

Visualization of Cell Composition and Maturation in the Bone Marrow Using 10‐Color Flow Cytometry and Radar Plots

2017· article· en· W2592730573 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCytometry Part B Clinical Cytometry · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreToronto General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFlow cytometryBone marrowVisualizationHaematopoiesisCellCytometryComputational biologyBiologyComputer scienceStem cellImmunologyData miningCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The enormous potential of complex data files generated by 10-color flow cytometry (FC) is hindered by the requirement for exhaustive manual gating and the complexity of multidimensional data visualization. We propose a model using radar plots (RPs), to improve FC data visualization by capturing multidimensionality and integration of FC findings. METHOD: We analysed 12 normal/reactive bone marrow (N/R BM) samples and 12 BM samples from patients with myelodysplasia (MDS) with 10-color FC. All identifiable cell clusters were individually marked, grouped, and visualized on radar plots. RPs were optimized to de-clutter the cell clusters and map BM cell composition and maturation. RESULTS: A total of 27 immature and mature cell clusters were identified and visualized on 8 multidimensional radar plots. The RPs displayed flow cytometry findings of normal BM in an integrated fashion to maximize overall insight into the data set. The constructed map of bone marrow cell composition was reproducible in all normal BM samples analyzed. Analysis of the pilot cohort of patient samples confirmed the presence of MDS-related changes. These changes are readily identifiable on RPs. CONCLUSION: We demonstrated that the cell clusters of normal BM can be mapped on multidimensional radar plots, which provide an inclusive insight into BM cell composition and maturation. These reproducible RPs present a comprehensive and comprehensible visual display of differentiation and maturation of haematopoietic cells in normal BM, and can be used as a reference map to assess abnormal haematopoiesis in MDS. © 2017 International Clinical Cytometry Society.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,228
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,088
Tête enseignante GPT0,419
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle