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Enregistrement W2592896010 · doi:10.1093/biolreprod/85.s1.795

DNA Repair Gene Expression Up-Regulation in Response to Phosphoramide Mustard Exposure in Cultured Rat Ovaries.

2011· article· en· W2592896010 sur OpenAlexaff
Shanthi Ganesan, Jill A. Madden, Poulomi Bhattacharya, James E. Koltes, Patrick J. Devine, Aileen F. Keating

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensUniversité du Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyDNAGeneDNA repairDNA damageMolecular biologyGene expressionExogenous DNAReal-time polymerase chain reactionCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cyclophosphamide (CPA) is used as an anti-neoplastic and immunosuppressant therapy in females. Phosphoramide Mustard (PM) is the ovotoxic metabolite of CPA, and destroys rapidly dividing cells by binding covalently to DNA, inducing DNA-DNA and DNA-protein crosslinks, and DNA double-strand breaks (DSB). Previous studies have shown that PM induces destruction of primordial and small primary follicles in a dose-dependent manner in cultured rat ovaries. Interestingly, PM induced follicle destruction is preceded by the appearance of DSBs in oocytes. This study was designed to explore the expression of genes involved in DNA repair at time points prior to the appearance of PM-induced DSBs. Fisher 344 postnatal day 4 rat ovaries were cultured in medium containing vehicle control (DMSO) ± PM (30 µM) for 2 or 4 days. Three biological replicates were used to perform a real-time RT-PCR array designed to identify genes involved in DNA repair. The data were analyzed using mixed models, correcting for multiple testing by lme4 and q value packages in R software. Relative to control treated ovaries, 18 and 3 repair genes were up-regulated (q < 0.1) on days 2 and 4, respectively, in response to PM exposure. A single gene, DNA polymerase delta 3 (Pold3) was increased at both time points. These results support that the ovary up-regulates genes involved in DNA repair in response to a DNA damaging xenobiotic exposure. It is likely that repeated ovotoxic chemical exposure eventually overwhelms this protective response, resulting in loss of oocytes containing imperfect DNA. (Supported by ES016818 to AFK). (poster)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,305
Score d'incertitude au seuil0,569

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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