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Enregistrement W2593201876 · doi:10.1111/bdi.12466

Investigation of correlations between DNA methylation, suicidal behavior and aging

2017· article· en· W2593201876 sur OpenAlexaff
Richie Jeremian, Yi‐An Chen, Vincenzo De Luca, John B. Vincent, James L. Kennedy, Clement C. Zai, John S. Strauss

Notice bibliographique

RevueBipolar Disorders · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick ChildrenCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesAmerican Foundation for Suicide Prevention
Mots-clésDNA methylationPsychologyClinical psychologyMedicineGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives Suicidal behavior ( SB ) is a major cause of mortality for patients diagnosed with bipolar disorder ( BD ). In this study, we investigated epigenetic differences in BD participants with and without a history of SB . Methods We used suicidality scores constructed from Schedule for Clinical Assessments in Neuropsychiatry ( SCAN ) interview questions about suicidal thought and behavior to identify individuals from a BD cohort of n=452; participants with the most extreme high (H‐ SB , n=18) and most extreme low (L‐ SB , n=22) scores were used as cases and controls, respectively. Epigenome‐wide DNA methylation patterns were compared between the two groups using the Illumina Infinium Human Methylation 450 BeadChip microarray. DNA methylation age was compared to chronological tissue age. Results We observed highly significant differences in methylation between cases and controls in three genomic regions enriched for epigenetic modifications corresponding to gene regulatory regions. BD participants with a history of SB showed less overall methylation in the 5′ untranslated region of Membrane palmitoylated protein 4 ( MPP 4 ) ( P =7.42×10 −7 ) and in intron 3 of TRE2/BUB2/CDC16 domain family member 16 ( TBC 1D16 ) ( P =6.47×10 −7 ), while exon 1 of Nucleoporin 133 ( NUP 133 ) was less methylated in controls ( P =1.17x10 ‐6 ). Moreover, we observed a greater correlation between DNA methylation age and tissue age in controls ( r =.91, P <.0001) than in the H‐ SB group ( r =.83, P <.0001). Conclusions We report significant findings at three loci based on a methylome scan of participants with BD for an SB phenotype, and potentially altered molecular aging in suicide attempters. Despite the small sample size, our proof‐of‐concept study highlights the potential for epigenetic factors to be useful in understanding the molecular underpinnings of suicide with the ultimate aim of its prevention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,112
Score d'incertitude au seuil0,378

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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