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Enregistrement W2593582196 · doi:10.1101/061101

A neuropeptide modulates sensory perception in the entomopathogenic nematode <i>Steinernema carpocapsae</i>

2016· preprint· en· W2593582196 sur OpenAlex
Robert Morris, Leonie Wilson, Matthew Sturrock, Neil D. Warnock, Daniel Carrizo, Deborah Cox, Kilian McGrath, Aaron G. Maule, Johnathan J. Dalzell

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Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2016
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEntomopathogenic Microorganisms in Pest Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesQueen's UniversityQueen's University BelfastLeverhulme TrustUniversity of California, IrvineBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésGene knockdownBiologyRNA interferenceFMRFamideEntomopathogenic nematodeRNA silencingCaenorhabditis elegansNematodeHost (biology)Biological dispersalGeneGeneticsRNANeuropeptideEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Entomopathogenic nematodes (EPNs) employ a sophisticated chemosensory apparatus to detect potential hosts. Understanding the molecular basis of relevant host-finding behaviours could facilitate improved EPN biocontrol approaches, and could lend insight to similar behaviours in economically important mammalian parasites. FMRFamide-like peptides are enriched and conserved across the Phylum Nematoda, and have been linked with motor and sensory function, including dispersal and aggregating behaviours in the free living nematode Caenorhabditis elegans . The RNA interference (RNAi) pathway of Steinernema carpocapsae was characterised in silico , and employed to knockdown the expression of the FMRFamide-like protein 21 (GLGPRPLRFamide) gene ( flp-21 ) in S . carpocapsae infective juveniles; a first instance of RNAi in this genus, and a first in an infective juvenile of any EPN species. Our data show that 5 mg/ml dsRNA and 50 mM serotonin triggers statistically significant flp-21 knockdown (-84%***) over a 48 h timecourse, which inhibits host-finding (chemosensory), dispersal, hyperactive nictation and jumping behaviours. However, whilst 1 mg/ml dsRNA and 50 mM serotonin also triggers statistically significant flp-21 knockdown (-51%**) over a 48 h timecourse, it does not trigger the null sensory phenotypes; statistically significant target knockdown can still lead to false negative results, necessitating appropriate experimental design. SPME GC-MS volatile profiles of two EPN hosts, Galleria mellonella and Tenebrio molitor reveal an array of shared and unique compounds; these differences had no impact on null flp-21 RNAi phenotypes for the behaviours assayed. Localisation of flp-21 / FLP-21 to paired anterior neurons by whole mount in situ hybridisation and immunocytochemistry corroborates the RNAi data, further suggesting a role in sensory modulation. These data can underpin efforts to study these behaviours in other economically important parasites, and could facilitate molecular approaches to EPN strain improvement for biocontrol. Author summary Entomopathogenic nematodes (EPNs) use a range of behaviours in order to find a suitable host, some of which are shared with important mammalian parasites. The ethical burden of conducting research on parasites which require a mammalian host has driven a move towards appropriate ‘model’ parasites, like EPNs, which have short life cycles, can be cultured in insects or agar plates, and have excellent genomic resources. This study aimed to develop a method for triggering gene knockdown by RNA interference, a biochemical pathway involved in gene regulation. Through knocking down the expression of a target gene we can then study the function of that gene, helping us to understand the molecular basis of behaviour. Here we have characterised the RNAi pathway of Steinernema carpocapsae through analysing the genome sequence for relevant genes, and have successfully knocked down the neuropeptide gene flp-21 in S . carpocapsae infective juveniles. We find that it is involved in the regulation of behaviours which rely on sensory perception and relate to host-finding. We have localised the gene and mature neuropeptide, and find them to be expressed in paired anterior neurons, which is in broad agreement with our behavioural observations following RNAi. Our observations are relevant to interactions of S . carpocapsae with two insect hosts, the waxworm Galleria mellonella , and the meelworm, Tenebrio molitor . We identified the volatile compounds relating to both insects, and find that there are both shared and unique compounds to both species; EPNs use volatile compound gradients, as well as other physical cues in order to find and invade a host. This study provides a method for employing RNAi in a promising model parasite, and characterises the molecular basis of host-finding behaviours which could be relevant to economically important mammalian parasites. EPNs are also used as bioinsecticides, and so understanding their behaviour and biology could have broad benefits across industry and academia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,740
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle