Substrate utilization by endophytic bacteria <i>Paenibacillus polymyxa</i> P2b-2R that may facilitate bacterial entrance and survival inside diverse plant hosts
Notice bibliographique
Résumé
Bacterial endophytes are thought to enter plants either through pre-existing openings in plant tissues or by creating openings by hydrolyzing major plant cell wall components. A lodgepole endophyte, Paenibacillus polymyxa P2b-2R, consistently formed endophytic colonies when inoculated in diverse plant hosts, viz., lodgepole pine, western red cedar, corn, canola, and tomato. We were interested to know, whether or not this bacterial strain possesses enzymes that can hydrolyze three major plant cell wall components namely cellulose, xylan, and pectin to facilitate entrance into the host plants. Using a BIOLOG assay, we also tested this bacterial strain’s ability to utilize carbon sources that might facilitate its entrance and hence its survival inside host plants. Paenibacillus polymyxa P2b-2R hydrolyzed sodium carboxymethylcellulose, beechwood xylan, and sodium polypectate and utilized 39 of the 95 carbon sources (41%) tested. Of the 39 carbon substrates oxidized by P2b-2R, the “carbohydrates” group represents the largest source of utilizable carbon (23 out of 39). Thus, it can be concluded that P. polymyxa P2b-2R is able to degrade major cell wall components (cellulose, xylan, and pectin) and utilize some of the available carbon substrates, possibly to gain entry and survive inside the plant and form endophytic colonies thereafter.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».