Deep sequencing of the prothoracic gland transcriptome reveals new players in insect ecdysteroidogenesis
Notice bibliographique
Résumé
Ecdysteroids are steroid hormones that induce molting and determine developmental timing in arthropods. In insect larva, the prothoracic gland (PG) is a major organ for ecdysone synthesis and release. Released ecdysone is converted into the active form, 20-hydroxyecdysone (20E) in the peripheral tissues. All processes from ecdysone synthesis and release from the PG to its conversion to 20E are called ecdysteroidogenesis and are under the regulation of numerous factors expressed in the PG and peripheral tissues. Classical genetic approaches and recent transcriptomic screening in the PG identified several genes responsible for ecdysone synthesis and release, whereas the regulatory mechanism remains largely unknown. We analyzed RNA-seq data of the silkworm Bombyx mori PG and employed the fruit fly Drosophila melanogaster GAL4/UAS binary RNAi system to comprehensively screen for genes involved in ecdysone synthesis and/or release. We found that the genes encoding δ-aminolevulinic acid synthase (CG3017/alas) and putative NAD kinase (CG33156) were highly expressed in the PG of both B. mori and D. melanogaster. Neither alas nor CG33156 RNAi-induced larvae could enter into the pupal stage, and they had a lower abundance of the active form ecdysteroids in their prolonged larval stage. These results demonstrated that alas and CG33156 are indispensable for ecdysteroidogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».