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Enregistrement W2594002668 · doi:10.1093/biolreprod/85.s1.81

Gene Expression Profile of In Vitro Produced Bovine Blastocysts Exposed to Hyperglycemia During Early Cleavage Stages: Link with the Warburg Effect.

2011· article· en· W2594002668 sur OpenAlexaff
Gaël Cagnone, Isabelle Dufort, Christian Vigneault, Claude Robert, Marc‐André Sirard

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensL'Alliance BoviteqUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlastocystBiologyEmbryoAndrologyGene expressionEmbryogenesisInner cell massEmbryo cultureConceptusMicroarray analysis techniquesIn vitroGeneMolecular biologyCell biologyGeneticsFetusPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hyperglycemia affects pre-implantation embryonic development and in vitro culture of mammalian embryos shows defined period of glucose toxicity. During this period, embryos rely primarily on oxidative phosphorylation and increased glycolysis has been correlated with developmental block at the time of embryonic genome activation. Although improvements have been made to overcome this developmental block, in vitro culture still enhances early embryo metabolism and results in poor quality blastocyst. To gain insight into the impact of in vitro culture on embryo development, we studied how enhanced metabolism affects gene expression profile of bovine embryo. In vitro produced bovine zygotes were cultured in control (0,2 mM) or high glucose (5 mM) condition during early cleavage stages then transfer to control media until reaching the blastocyst stage. We selected a 5 mM glucose exposure as hyperglycemic treatment because glucose concentration in bovine oviduct is around 2 mM and in vitro dose response experiment showed embryo-lethality at 10 mM. Microarray technology was used to compare gene expression differences between control and treated blastocysts. Glucose treatment decreases significantly the blastocyst and hatching rate compared to control (22.8% vs 37.9% and 28.8% vs 43.8%, respectively). Microarray comparison reveals a total of 104 differentially expressed probes between treated and control blastocysts (1.5 fold-change; p<0.05), targeting 64 constitutive genes, 16 3'untranslated regions, 2 splice variants and 22 uncharacterised genes. Differentially expressed genes are not related to embryo sex or hatching. Over-represented processes among differentially expressed genes in treated blastocysts are cell-adhesion, oxidative stress and glucose metabolism. Functional analysis indicts a major up-regulation of genes controlling the Warburg effect i.e emphasis to use aerobic glycolysis rather than oxidative phosphorylation. Q-PCR experiments validate genes known as markers of the Warburg effect in cancer progression (LDHA,TKTL1) as well as genes involved in metabolic stress (PPARg,TP53BP2) and extracellular matrix remodelling (ADAMTS1). These observations allowed us to conclude that hyperglycemic condition during in vitro pre-attachment development modifies subsequent expression of genes involved in metabolic control in bovine blastocyst and that these modifications could be linked to embryo quality. This research is financed by NSERC-EmbryoGENE and the Institute of Nutraceuticals and Functional Foods. (platform)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,302
Score d'incertitude au seuil0,502

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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