MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2594247429 · doi:10.1093/biolreprod/85.s1.317

Role of Imitation Switch (ISWI) Chromatin Remodeling Proteins During Mouse Preimplantation Embryo Development and Embryonic Stem Cell Differentiation.

2011· article· en· W2594247429 sur OpenAlexaff
Francois Paradis, David Pépin, Warren M. Meyers, Barbara C. Vanderhyden

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyEmbryonic stem cellZygoteCell biologyBlastocystEmbryoChromatin remodelingEmbryogenesisInner cell massCellular differentiationAndrologyChromatinGeneticsMolecular biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Female fertility is dependent on the ability of the oocytes and embryos to follow the developmental program to yield healthy offspring. The preimplantation embryo needs to undergo crucial processes including maternal to zygotic transition and cell differentiation that require profound changes in gene expression dependent on global chromatin remodeling. The ISWI proteins constitute the catalytic subunit of chromatin remodeling complexes capable of altering nucleosome positioning and regulating gene transcription. Two ISWI proteins, Snf2h and Snf2l, have been identified in the mouse and Snf2h was shown to be essential for embryonic development. Interestingly, embryonic stem cells (ESC) could not be derived from Snf2h knockout embryos suggesting a role for Snf2h in the maintenance of pluripotency. However, still very little is known about the roles of Snf2h and Snf2l in mouse oocytes and preimplantation embryos and during stem cell differentiation. Therefore, our aim was to characterize the expression of Snf2h and Snf2l during mouse preimplantation embryo development and embryonic stem cell differentiation. Germinal vesicle (GV) and metaphase II (MII) oocytes and zygotes were recovered from superovulated 25-day old C57BL/6 mice and zygotes were further cultured in KSOM with amino acids to obtain 2-cell embryos, 4-cell embryos, morulae and blastocysts. Total RNA was extracted from groups of 20 oocytes or embryos, reverse transcribed and the levels of expression of Snf2h and Snf2l, normalized to exogenous GFP, were determined by Q-PCR. Groups of oocytes and embryos were also subjected to immunofluorescence for Snf2h localization. ESC were cultured with LIF and induced to differentiate for 0h, 48h or 96h in LIF-free media supplemented with 1 micromole of retinoic acid. Total RNA was extracted, reverse transcribed and the levels of expression of Snf2l, Snf2h, Pou5f1, Nanog and miR-100, normalized to PMSD or miR-191, were determined by Q-PCR. Snf2h and Snf2l protein abundance was quantified by immunoblotting using beta-actin as an endogenous control. All data were analyzed using the general linear model procedure of SAS. Snf2l mRNA could not be reliably detected at any stage of embryo development while Snf2h mRNA behaved as a typical maternal mRNA, decreasing in abundance from GV oocytes to 2-cell embryos and increasing thereafter. Snf2h protein was found to localize to the cytoplasm and nucleus of GV and MII oocytes, zygotes and 2-cell embryos while it was found to localize predominantly to the nucleus of 4-cell embryos, morulae and blastocysts. Interestingly, blastomeres in anaphase or telophase did not positively stain for Snf2h. Immunofluorescence also revealed strong staining at the blastocyst stage, suggesting a role for Snf2h in ESC. ESC differentiation was accompanied by changes in cell morphology and by the reduction in Pou5f1 and Nanog mRNA. Similarly, a decrease in Snf2h protein abundance was observed while its mRNA abundance remained relatively unchanged, suggesting that it might be regulated post-transcriptionally. The increase in miR-100 abundance observed during ESC differentiation strongly supports this concept. In conclusion, our results support the hypothesis that Snf2h is important for the maintenance of the pluripotent state in embryonic stem cells and that its expression is likely under the control of miR-100. F. Paradis is supported by fellowships from CIHR-REDIH and the Lalor Foundation. (poster)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,476

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiology of ReproductionMême sujetAnimal Genetics and ReproductionTravaux en français237 207