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Enregistrement W2594515991 · doi:10.1055/s-2005-862998

Influence of retinoic acid on post-translational modifications of a-enolase in the human follicular thyroid carcinoma cell line FTC-133

2005· article· en· W2594515991 sur OpenAlexaff
Bogusz Trojanowicz, Annette Winkler, Kathrin Hammje, Z Chen, Carsten Sekulla, Dagobert Glanz, Cornelia Schmutzler, Birgit Mentrup, Sabine Hombach‐Klonisch, Thomas Klonisch, R. Finke, Josef Köhrle, Henning Dralle, C Hoang-Vu

Notice bibliographique

RevueExperimental and Clinical Endocrinology & Diabetes · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRetinoic acidEnolaseFollicular phaseThyroid carcinomaCell culturePhosphoenolpyruvate carboxykinaseBiochemistryEnzymeThyroidGlycolysisFollicular cellBiologyChemistryEndocrinologyInternal medicineCancer researchMedicineImmunohistochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enolases (2-phospho-D-glycerate hydrolases) are glycolytic enzymes that catalyse the interconversion of 2-phosphoglycerate to phosphoenolpyruvate, may also be involved in cellular differentiation. In this study we investigated the influence of retinoic acid (RA) on the proteome, the 48 kDa human α-enolase (ENO1) and its post-translational modifications in the follicular thyroid carcinoma cell line FTC-133. FTC 133 cells was cultured in DMEM/F12, stimulated with 1µM RA for 24h and 72h. Total RNA for RT-PCR was obtained using Trizol. For two dimensional (2D) gel analyses, total protein was extracted with either lysis buffer A (8M Urea, 4% CHAPS, 1% DTT, 0.8% Pharmalyte) or lysis buffer B (7M Urea, 2M Thiourea, 4% CHAPS, 2% Pharmalyte, 2% DTT) for standard 2D gel electrophoresis and silver staining gels or 2D fluorescence difference gel electrophoresis (DIGE), respectively. Spots were isolated and prepared for mass spectrometry (MALDI-Tof MS and MS/MS) analyses. RT-PCR showed no significant differences in ENO1 mRNA expression. Western blot and 2D gel analyses revealed RA-mediated up-regulation of ENO1 protein production. In addition, eleven not yet determined protein spots were up-regulated upon RA treatment. ENO1 was identified and sequenced using tandem mass spectrometry (MS/MS). Modification mapping revealed that RA induced dephosphorylation of tyrosine236 and threonine237 but phosphorylation of serine349 and threonine351. In contrast to controls, RA induced deacetylation of peptides in positions 328–330 IAK and 404–406 LAK, whereas residue methionine368 was acetylated. No changes were observed in ENO1 glycolysation upon RA treatment. RA induced calcium- and phospholipide-independent kinases. Phosphoprotein staining showed that RA affected the phosphorylation status in FTC-133. Our data show that RA increases the number of protein spots, ENO1 protein expression level and induces changes in the phosphorylation and acetylation of ENO1. The biological significance of de-/phosphorylation and de-/acetylation of the ENO1 in FTC-133 cells still requires clarification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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