Influence of retinoic acid on post-translational modifications of a-enolase in the human follicular thyroid carcinoma cell line FTC-133
Notice bibliographique
Résumé
Enolases (2-phospho-D-glycerate hydrolases) are glycolytic enzymes that catalyse the interconversion of 2-phosphoglycerate to phosphoenolpyruvate, may also be involved in cellular differentiation. In this study we investigated the influence of retinoic acid (RA) on the proteome, the 48 kDa human α-enolase (ENO1) and its post-translational modifications in the follicular thyroid carcinoma cell line FTC-133. FTC 133 cells was cultured in DMEM/F12, stimulated with 1µM RA for 24h and 72h. Total RNA for RT-PCR was obtained using Trizol. For two dimensional (2D) gel analyses, total protein was extracted with either lysis buffer A (8M Urea, 4% CHAPS, 1% DTT, 0.8% Pharmalyte) or lysis buffer B (7M Urea, 2M Thiourea, 4% CHAPS, 2% Pharmalyte, 2% DTT) for standard 2D gel electrophoresis and silver staining gels or 2D fluorescence difference gel electrophoresis (DIGE), respectively. Spots were isolated and prepared for mass spectrometry (MALDI-Tof MS and MS/MS) analyses. RT-PCR showed no significant differences in ENO1 mRNA expression. Western blot and 2D gel analyses revealed RA-mediated up-regulation of ENO1 protein production. In addition, eleven not yet determined protein spots were up-regulated upon RA treatment. ENO1 was identified and sequenced using tandem mass spectrometry (MS/MS). Modification mapping revealed that RA induced dephosphorylation of tyrosine236 and threonine237 but phosphorylation of serine349 and threonine351. In contrast to controls, RA induced deacetylation of peptides in positions 328–330 IAK and 404–406 LAK, whereas residue methionine368 was acetylated. No changes were observed in ENO1 glycolysation upon RA treatment. RA induced calcium- and phospholipide-independent kinases. Phosphoprotein staining showed that RA affected the phosphorylation status in FTC-133. Our data show that RA increases the number of protein spots, ENO1 protein expression level and induces changes in the phosphorylation and acetylation of ENO1. The biological significance of de-/phosphorylation and de-/acetylation of the ENO1 in FTC-133 cells still requires clarification.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».