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Enregistrement W2594599876 · doi:10.1038/nmeth.4185

EV-TRACK: transparent reporting and centralizing knowledge in extracellular vesicle research

2017· article· en· W2594599876 sur OpenAlexaff
Jan Van Deun, Pieter Mestdagh, Patrizia Agostinis, Özden Akay, Sushma Anand, Jasper Anckaert, Zoraida Andreu Martínez, Tine Baetens, Els Beghein, Laurence Bertier, Geert Berx, Janneke Boere, Stephanie Boukouris, Michel Bremer, Dominik Buschmann, James Brian Byrd, Clara Casert, Lesley Cheng, Anna Cmoch, Delphine Daveloose, Eva De Smedt, Şeyma Demirsoy, Victoria Depoorter, Bert Dhondt, Tom A. P. Driedonks, Aleksandra M. Dudek, Abdou ElSharawy, Ilaria Floris, Andrew D. Foers, Kathrin Gärtner, Abhishek D. Garg, Edward Geeurickx, Jan Gettemans, Farzaneh Ghazavi, Bernd Giebel, Tom Groot Kormelink, Grace Hancock, Hetty Helsmoortel, Andrew F. Hill, Vincent Hyenne, Hina Kalra, David Kim, Joanna Kowal, Sandra Kraemer, Petra Leidinger, Carina Leonelli, Yaxuan Liang, Lien Lippens, Shu Liu, Alessandra Lo Cicero, Shaun Martin, Suresh Mathivanan, Prabhu Mathiyalagan, Tamás Matusek, Gloria Milani, Liselot Mus, Dillon C. Muth, Andrea H. Németh, Esther N. M. Nolte‐‘t Hoen, Lorraine O’Driscoll, Roberta Palmulli, Michael W. Pfaffl, Bjarke Primdal-Bengtson, Erminia Romano, Quentin Rousseau, Susmita Sahoo, Natália G. Sampaio, Monisha Samuel, Benjamin J. Scicluna, Bieke Soen, Anneleen Steels, Johannes V. Swinnen, Maarit Takatalo, Safia Thaminy, Clotilde Théry, Joeri Tulkens, Isabel Van Audenhove, Susanne van der Grein, Alan Van Goethem, Martijn J. C. van Herwijnen, Guillaume van Niel, Nadine Van Roy, Alexander R. van Vliet, Niels Vandamme, Suzanne Vanhauwaert, Glenn Vergauwen, Frederik J. Verweij, Annelynn Wallaert, Marca H. M. Wauben, Kenneth W. Witwer, Marijke I. Zonneveld, Olivier De Wever, Jo Vandesompele, An Hendrix

Notice bibliographique

RevueNature Methods · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésExtracellular vesiclesExtracellular vesicleCrowdsourcingTrack (disk drive)Replication (statistics)Computer scienceInterpretation (philosophy)Data scienceField (mathematics)Computational biologyBiologyCell biologyWorld Wide WebGeneticsGeneMicrovesiclesVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,014
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,028
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,986
Score d'incertitude au seuil0,075

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0140,028
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0080,010
Science ouverte0,0040,013
Intégrité de la recherche0,0050,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,146
Tête enseignante GPT0,530
Écart entre enseignants0,385 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 300
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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