Mean-field analysis of two-species totally asymmetric simple exclusion process (TASEP) with attachment and detachment
Notice bibliographique
Résumé
In the field of statistical physics, unidirectional motion of a large number of particles along a single track can be described by totally asymmetric simple exclusion process (TASEP), from which many meaningful properties, such as the appearance of domain wall (defined as the borderline of high particle density and low particle density along the motion track) and boundary layers, can be obtained. However, it is biologically general that a single track may be occupied by different particle species. For example, in cells each microtubule protofilament is usually occupied by different species of motor protein. So previous studies about TASEP that included only one particle species may not be reasonable enough to describe more detailed properties of particle motion processes in a real cell environment. To address this problem, TASEP including two particle species is discussed in this study. Theoretical methods to get particle densities of each species are provided. By which, phase transition related properties of particle densities are obtained. Our analysis shows that domain wall and boundary layers of single species densities always appear simultaneously with those of the total particle density. The height of the domain wall of total particle density is equal to the summation of those of single particle species. Phase diagrams for typical model parameters are also presented. The methods presented in this study can be generalized to analyze TASEP with more particle species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».