Potassium Channel Candidate Genes Predict the Development of Secondary Lymphedema Following Breast Cancer Surgery
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Potassium (K) channels play an important role in lymph pump activity, lymph formation, lymph transport, and the functions of lymph nodes. No studies have examined the relationship between K channel candidate genes and the development of secondary lymphedema (LE). OBJECTIVE: The study purpose was to evaluate for differences in genotypic characteristics in women who did (n = 155) or did not (n = 387) develop upper extremity LE following breast cancer treatment based on an analysis of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and haplotypes in 10 K channel genes. METHODS: Upper extremity LE was diagnosed using bioimpedance resistance ratios. Logistic regression analyses were used to identify those SNPs and haplotypes that were associated with LE while controlling for relevant demographic, clinical, and genomic characteristics. RESULTS: Patients with LE had a higher body mass index, had a higher number of lymph nodes removed, had more advanced disease, received adjuvant chemotherapy, received radiation therapy, and were less likely to have undergone a sentinel lymph node biopsy. One SNP in a voltage-gated K channel gene (KCNA1 rs4766311), four in two inward-rectifying K channel genes (KCNJ3 rs1037091 and KCNJ6 rs2211845, rs991985, rs2836019), and one in a two-pore K channel gene (KCNK3 rs1662988) were associated with LE. DISCUSSION: These preliminary findings suggest that K channel genes play a role in the development of secondary LE.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».