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Enregistrement W2594864286 · doi:10.1039/c7ob00445a

Synthetic glycoconjugates characterize the fine specificity of Brucella A and M monoclonal antibodies

2017· article· en· W2594864286 sur OpenAlexafffund
Satadru Sekhar Mandal, N. Vijaya Ganesh, Joanna Sadowska, David R. Bundle

Notice bibliographique

RevueOrganic & Biomolecular Chemistry · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueBrucella: diagnosis, epidemiology, treatment
Établissements canadiensAlberta Hospital EdmontonUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésEpitopeMonoclonal antibodyTetrasaccharideChemistryTrisaccharideGlycoconjugateAntigenAntigenicityAntibodyBiochemistryResidue (chemistry)Molecular biologyPolysaccharideBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The dominant cell wall antigen of Brucella bacteria is the O-polysaccharide component of the smooth lipopolysaccharide. Infection by various Brucella biovars causes abortions and infertility in a wide range of domestic and wild animals and debilitating disease in humans. Diagnosis relies on the detection of antibodies to the A and M antigens expressed in the O-polysaccharide. This molecule is a homopolymer of the rare monosaccharide, 4-formamido-4,6-dideoxy-d-mannopyranose (Rha4NFo). The A epitope is created by a uniform α1,2 linked internal polymeric sequence capped by a distinct tetrasaccharide sequence defining the M antigen. Unique oligosaccharides only available by chemical synthesis and conjugated via reducing and non-reducing residues to bovine serum albumin have revealed the structural basis of the fine specificity that allows the discrimination of these closely related A and M epitopes. All three M specific monoclonal antibodies (mAbs) are inferred to possess groove type binding sites open at each end, and recognize an α1,3 linked Rha4NFo disaccharide as a part of a trisaccharide epitope, which in two mAbs includes the terminal Rha4NFo residue. The binding site of one of these antibodies is sufficiently large to engage up to six Rha4NFo residues and involves weak recognition of α1,2 linked Rha4NFo residues. The third mAb binds an internal trisaccharide epitope of the M tetrasaccharide. Two A specific mAbs also possess groove type binding sites that accommodate six and four α1,2 linked Rha4NFo residues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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