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Enregistrement W2594889731 · doi:10.1186/s13075-017-1243-y

Presence of an interferon signature in individuals who are anti-nuclear antibody positive lacking a systemic autoimmune rheumatic disease diagnosis

2017· article· en· W2594889731 sur OpenAlexafffund
Joan Wither, Sindhu R. Johnson, Tony Liu, Babak Noamani, Dennisse Bonilla, Larissa Lisnevskaia, Earl D. Silverman, Arthur Bookman, Carolina Landolt-Marticorena

Notice bibliographique

RevueArthritis Research & Therapy · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Lupus Erythematosus Research
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenMount Sinai HospitalLakeridge HealthToronto Western HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoArthritis SocietyCanadian Rheumatology AssociationUniversity Health Network
Mots-clésRheumatologyMedicineImmunologyRheumatic diseaseAntibodyAutoimmune diseaseDiseaseAutoantibodyInterferonInternal medicineRheumatoid arthritis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elevated levels of type I interferons (IFNs) are a characteristic feature of the systemic autoimmune rheumatic diseases (SARDs) and are thought to play an important pathogenic role. However, it is unknown whether these elevations are seen in anti-nuclear antibody–positive (ANA+) individuals who lack sufficient criteria for a SARD diagnosis. We examined IFN-induced gene expression in asymptomatic ANA+ individuals and patients with undifferentiated connective tissue disease (UCTD) to address this question. Healthy ANA− control subjects and ANA+ titre (≥1:160 by immunofluorescence) participants meeting no criteria, meeting at least one criterion (UCTD) or meeting SARD classification criteria were recruited. Whole peripheral blood IFN-induced and BAFF gene expression were quantified using NanoString technology. The normalized levels of five IFN-induced genes were summed to produce an IFN5 score. The mean IFN5 scores were increased in all ANA+ participant subsets as compared with healthy control subjects. We found that 36.8% of asymptomatic ANA+ and 50% of UCTD participants had IFN5 scores >2 SD above the mean for healthy control subjects. In all ANA+ subsets, the IFN5 score correlated with the presence of anti-Ro/La antibodies. In the asymptomatic ANA+ subset, this score also correlated with the ANA titre, whereas in the other ANA+ subsets, it correlated with the number of different ANA specificities. Development of new SARD criteria was seen in individuals with normal and high IFN5 scores. An IFN signature is seen in a significant proportion of ANA+ individuals and appears to be associated with ANA titre and type of autoantibodies, rather than with the presence or development of clinical SARD symptoms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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